More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2020 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2020  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 343 aa  675    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257834  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  37.65 
 
 		 304 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 304 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 314 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  33.04 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 		 335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  32.63 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  29.21 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 356 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  32.77 
 
 		 299 aa  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 321 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 306 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 320 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3439  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.444229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 317 aa  112  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6646  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 316 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 316 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 323 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4418  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 417 aa  106  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3914  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 321 aa  105  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 326 aa  105  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4205  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 316 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4006  LysR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00309329  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0626  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.284859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0310  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179801  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1713  LysR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 310 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0202364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3031  LysR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 324 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0317613  normal  0.872582 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 316 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  27.34 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  29.77 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1305  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111615  normal  0.494502 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38270  pca operon transcription factor PcaQ  29.43 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31260  Transcriptional regulator, LysR family  30.5 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04629  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  30.86 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4461  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1262  LysR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 310 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0948373  normal  0.0721838 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0642  transcriptional regulator PcaQ  28.16 
 
 		 302 aa  99.4  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5247  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 323 aa  99.4  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0614606  normal  0.32448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0230  transcriptional regulator PcaQ  31.6 
 
 		 305 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  30.86 
 
 		 314 aa  99.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  26.11 
 
 		 315 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 298 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 315 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3202  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 397 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0604  pca operon transcription factor PcaQ  28.16 
 
 		 302 aa  99  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 298 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  29.17 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4033  putative LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.652401 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  29.24 
 
 		 327 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 415 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4089  transcriptional regulator, LysR family  31.22 
 
 		 297 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3724  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 304 aa  96.3  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  26.69 
 
 		 325 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3495  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>