More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0289 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 339 aa  682    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  71.29 
 
 		 314 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  47.54 
 
 		 335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 333 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 321 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 316 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 316 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 316 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 322 aa  192  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 316 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 316 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 310 aa  189  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 323 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  35.54 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 312 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  35.22 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 320 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 320 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  33.76 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  33.69 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 319 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 308 aa  164  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 318 aa  163  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  32.74 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  33.08 
 
 		 314 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  33.08 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  32.44 
 
 		 304 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 356 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  34.71 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 312 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  31.43 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2023  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 305 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3178  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2539  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  30.88 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 313 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 314 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 313 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 316 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 315 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 315 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 315 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 417 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 314 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 307 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1532  LysR substrate binding domain protein  30.85 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1739  LysR substrate binding domain protein  30.85 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1803  LysR substrate binding domain-containing protein  30.85 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  31.68 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1743  LysR substrate binding domain protein  30.85 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.574272 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1717  LysR substrate binding domain-containing protein  30.85 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0492643 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4461  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 		 314 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3495  LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 328 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563303 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  28.93 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4027  LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2027  transcriptional regulator, LysR family  29.83 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.294769  hitchhiker  0.0000000175537 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  28.9 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 351 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1601  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 307 aa  119  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1752  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 307 aa  119  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.53029e-17 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1647  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 307 aa  119  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.997012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1504  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 307 aa  119  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>