More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2084 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  610  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  81.64 
 
 		 323 aa  494  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  76.95 
 
 		 313 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  69.41 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  64.14 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  59.21 
 
 		 312 aa  353  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 321 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 317 aa  176  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 341 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  36.75 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  36.48 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  35.88 
 
 		 331 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  37.05 
 
 		 319 aa  162  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 320 aa  159  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 315 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 351 aa  155  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 328 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3572  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  33.91 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3439  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.444229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5026  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.89 
 
 		 325 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572063  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  31.75 
 
 		 302 aa  149  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5194  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 354 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 313 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 314 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 316 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 316 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 320 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  33.55 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 316 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  31 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  35.94 
 
 		 335 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  34.39 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4012  putative LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 317 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 314 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6646  transcriptional regulator, LysR family  36.5 
 
 		 316 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 315 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 314 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 315 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 314 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 332 aa  142  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6759  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 339 aa  135  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4461  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  31.56 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1856  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal  0.189017 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2774  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6408  transcriptional regulator, LysR family  30.46 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 369 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  34.44 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  34.3 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4981  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 323 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3495  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563303 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4027  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 419 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1440  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  34.16 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2020  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 343 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257834  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 317 aa  125  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4418  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.43525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2663  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 323 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4062  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>