More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3807 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 326 aa  667    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 325 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  35.53 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 331 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 		 319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  35.22 
 
 		 314 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 316 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 320 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 317 aa  189  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 299 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  31.49 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 321 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 323 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 317 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  28.71 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 339 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  28.06 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  28.16 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 312 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 356 aa  136  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  28.39 
 
 		 335 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0310  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179801  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 315 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  28.12 
 
 		 313 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  29.43 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 323 aa  133  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 332 aa  133  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4635  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  28.08 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2023  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  27.97 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 341 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  30.88 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1262  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 310 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0948373  normal  0.0721838 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  27.51 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2539  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3178  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  27.42 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 315 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 318 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 419 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4418  LysR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 322 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 417 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0704  LysR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.271413  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4006  LysR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00309329  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0713  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.411699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1713  LysR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0202364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1305  LysR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111615  normal  0.494502 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5583  transcriptional regulator, LysR family  26.97 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2503  LysR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1440  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  28.82 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 305 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 313 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 415 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2000  transcriptional regulator, LysR family  27.1 
 
 		 299 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40236  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4033  putative LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 326 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.652401 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6156  LysR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>