More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6156 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6156  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  627  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2000  transcriptional regulator, LysR family  67.45 
 
 		 299 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40236  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5915  LysR family transcriptional regulator  67.55 
 
 		 303 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2503  LysR family transcriptional regulator  67.56 
 
 		 306 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2608  LysR family transcriptional regulator  68.33 
 
 		 303 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1974  LysR family transcriptional regulator  67.66 
 
 		 303 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2584  LysR family transcriptional regulator  67.66 
 
 		 303 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0798399  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0713  LysR family transcriptional regulator  66.34 
 
 		 328 aa  391  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.411699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2632  LysR family transcriptional regulator  66.56 
 
 		 306 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.724671  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0704  LysR family transcriptional regulator  66.22 
 
 		 338 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.271413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0889  LysR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 338 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0886  LysR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 338 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0376917  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0092  LysR family transcriptional regulator  64.58 
 
 		 298 aa  363  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0215492  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2479  LysR family transcriptional regulator  64.58 
 
 		 298 aa  363  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0345  LysR family transcriptional regulator  64.58 
 
 		 332 aa  362  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0644  LysR family transcriptional regulator  64.58 
 
 		 332 aa  362  3e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0772357  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1678  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 318 aa  189  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5051  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443716  normal  0.966436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3275  transcriptional regulator, LysR family  29.01 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0115346  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3111  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.01 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5902  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 307 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5583  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1848  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 316 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 316 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1380  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8309  transcriptional regulator, LysR family  30.27 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 316 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.01 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 316 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0720  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.77 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.42 
 
 		 302 aa  119  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.42 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  28.42 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.42 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.42 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.42 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 417 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  28.42 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2373  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0629728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1366  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 481 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.88 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.85 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 326 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4432  LysR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3970  LysR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1299  LysR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2237  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956085 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1504  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1601  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1752  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.53029e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01379  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.8 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2224  transcriptional regulator, LysR family  26.8 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1647  transcriptional regulator, LysR family  26.12 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.997012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01391  hypothetical protein  26.8 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5758  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0665563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4199  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.11 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5236  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  29.24 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2027  transcriptional regulator, LysR family  26.46 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.294769  hitchhiker  0.0000000175537 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5744  transcriptional regulator, LysR family  28.43 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0821476  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3822  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.563678  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4546  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.471439  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  28.28 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1739  LysR substrate binding domain protein  27.84 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1532  LysR substrate binding domain protein  27.84 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1743  LysR substrate binding domain protein  27.84 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.574272 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1717  LysR substrate binding domain-containing protein  27.84 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0492643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1803  LysR substrate binding domain-containing protein  27.84 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0475  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 301 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111111  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 331 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  27.7 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1964  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5159  LysR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4103  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 300 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  26.71 
 
 		 302 aa  106  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2069  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00114846 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 419 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000192  transcriptional regulator LysR family  29.33 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0226889  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  27.05 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2874  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000130864  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1615  LysR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979938  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0822  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.835428  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0871  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2894  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0369741  normal  0.204254 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2387  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274334 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2590  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  28.27 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0791  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>