More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4635 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4635  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 318 aa  631  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3983  LysR family transcriptional regulator  72.2 
 
 		 330 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1220  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2501  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 322 aa  115  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  30.19 
 
 		 325 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  32.54 
 
 		 313 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 317 aa  112  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3964  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0923381  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4033  putative LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 326 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.652401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0215  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4461  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  32.92 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3202  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 314 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 320 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 316 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2516  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  34.11 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2663  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3495  LysR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563303 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  30.27 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  31.41 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4027  LysR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  32.1 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4981  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 417 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  28.07 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3031  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0317613  normal  0.872582 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.34 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2093  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 408 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  30.28 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4418  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  30.29 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  31.71 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 313 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 316 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 316 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 318 aa  99.4  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 317 aa  99.4  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2585  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3439  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.444229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2029  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 397 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.88 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 331 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 351 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2711  LysR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 306 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5194  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 354 aa  96.7  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 419 aa  96.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5247  LysR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 323 aa  96.3  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0614606  normal  0.32448 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 305 aa  96.3  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 321 aa  96.3  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0886  LysR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0376917  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  34.72 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0889  LysR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  27.41 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0704  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.271413  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31260  Transcriptional regulator, LysR family  32.85 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 323 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3275  transcriptional regulator, LysR family  31.74 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0115346  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  34.72 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6408  transcriptional regulator, LysR family  29.17 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3922  LysR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 404 aa  92.8  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 315 aa  92.8  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0092  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0215492  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2479  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>