More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2093 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2093  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 408 aa  817    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2516  LysR family transcriptional regulator  60.35 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2029  LysR family transcriptional regulator  60.35 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3202  LysR family transcriptional regulator  60.1 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31260  Transcriptional regulator, LysR family  59.75 
 
 		 397 aa  448  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0095  LysR family substrate binding transcriptional regulator  56.5 
 
 		 411 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0094  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  56.5 
 
 		 411 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4119  LysR family transcriptional regulator  57.22 
 
 		 392 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 415 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 419 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 417 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5744  transcriptional regulator, LysR family  50.25 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0821476  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3707  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 406 aa  292  9e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0214669 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 417 aa  242  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3897  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 414 aa  239  8e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3922  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 404 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1366  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 481 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03234  transcriptional regulator  33.17 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3891  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3271  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 421 aa  170  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2816  LysR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 383 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0493129  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3811  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.310651 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3111  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29 
 
 		 300 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  32.4 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 313 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3275  transcriptional regulator, LysR family  29 
 
 		 300 aa  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0115346  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1518  transcriptional regulator, LysR family  29.15 
 
 		 316 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2956  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3543  LysR family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 419 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0643746  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  32.24 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  25.08 
 
 		 302 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5159  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  31.01 
 
 		 304 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 		 314 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1848  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 314 aa  113  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6759  transcriptional regulator, LysR family  30.17 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8309  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2659  OsmT protein  31.97 
 
 		 308 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  30.22 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0338  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 410 aa  111  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  30.62 
 
 		 325 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  29.24 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1826  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 316 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0150451  hitchhiker  0.00784297 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 316 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 316 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2774  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 337 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 304 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 316 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0642  transcriptional regulator PcaQ  28 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3724  LysR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2121  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.64 
 
 		 306 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.547513  normal  0.230532 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0604  pca operon transcription factor PcaQ  28 
 
 		 302 aa  107  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4461  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2568  OsmT protein  31.29 
 
 		 308 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0008695  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2617  OsmT protein  31.29 
 
 		 308 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2789  OsmT protein  31.29 
 
 		 308 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4981  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 323 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2683  OsmT protein  31.29 
 
 		 308 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.567691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 316 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 369 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 316 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5236  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 311 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 317 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0507  LysR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4103  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 300 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2373  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 300 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0629728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1856  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 328 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal  0.189017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  31.21 
 
 		 314 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 321 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3572  transcriptional regulator, LysR family  30.87 
 
 		 322 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.27 
 
 		 298 aa  104  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 317 aa  104  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  31.21 
 
 		 314 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  30.28 
 
 		 299 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4635  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 318 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5938  transcriptional regulator, LysR family  28.19 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.254792 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1299  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38270  pca operon transcription factor PcaQ  31.33 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  28.07 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3970  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4432  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4463  transcriptional regulator, LysR family  31.46 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 308 aa  101  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>