More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3543 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3543  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 419 aa  844    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0643746  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2816  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 383 aa  250  4e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0493129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03234  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 435 aa  225  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3922  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 404 aa  199  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3891  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 400 aa  187  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 419 aa  153  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  31.59 
 
 		 417 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3271  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 415 aa  142  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1366  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 481 aa  137  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3897  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3707  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0214669 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2093  LysR family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 408 aa  119  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31260  Transcriptional regulator, LysR family  30.14 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3811  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.310651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3202  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2516  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2029  LysR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 397 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3724  LysR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 304 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5744  transcriptional regulator, LysR family  29.18 
 
 		 434 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0821476  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4119  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0094  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  28.41 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0095  LysR family substrate binding transcriptional regulator  28.41 
 
 		 411 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0604  pca operon transcription factor PcaQ  32.08 
 
 		 302 aa  99.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0642  transcriptional regulator PcaQ  32.08 
 
 		 302 aa  99.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 339 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4205  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 316 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1262  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 310 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0948373  normal  0.0721838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4006  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 310 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00309329  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 312 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1713  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 310 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0202364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3914  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 321 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5938  transcriptional regulator, LysR family  26.64 
 
 		 305 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.254792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1305  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 310 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111615  normal  0.494502 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 321 aa  92  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 316 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7076  transcriptional regulator, LysR family  28.64 
 
 		 305 aa  89.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0338  LysR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 316 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6124  pca operon transcription factor PcaQ  32.46 
 
 		 284 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0261121  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 315 aa  88.2  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 315 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 315 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 315 aa  87  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2686  LysR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3489  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  28.33 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4160  LysR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.181035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  25.56 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0230  transcriptional regulator PcaQ  27.5 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1440  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  27.88 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 314 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 313 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  28.28 
 
 		 314 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  27.92 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2069  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00114846 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1368  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0323343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54710  putative transcriptional regulator  28.63 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0282629  hitchhiker  0.000000212849 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  27.61 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2337  pca operon transcriptional activator PcaQ  25.95 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.269299  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4655  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0129573  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1856  LysR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal  0.189017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38270  pca operon transcription factor PcaQ  28.46 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  25.56 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4199  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.57 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1380  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3572  transcriptional regulator, LysR family  30.99 
 
 		 322 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 351 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2121  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.52 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.547513  normal  0.230532 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5583  transcriptional regulator, LysR family  27.63 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0206  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1663  LysR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0296  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5247  LysR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0614606  normal  0.32448 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0310  LysR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179801  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4781  putative transcriptional regulator  29.01 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1244  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 300 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1940  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 300 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 341 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0957  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 300 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 314 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  28.3 
 
 		 331 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0222  LysR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 307 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2219  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 300 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1752  LysR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.53029e-17 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0218  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2027  transcriptional regulator, LysR family  25.11 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.294769  hitchhiker  0.0000000175537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  24.41 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>