More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3375 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 314 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  98.41 
 
 		 314 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  98.41 
 
 		 314 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  95.54 
 
 		 314 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  90 
 
 		 314 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  65.57 
 
 		 313 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  62.95 
 
 		 307 aa  360  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  48.03 
 
 		 304 aa  258  8e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  48.36 
 
 		 304 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 321 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 316 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 313 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 313 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  32.57 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  36.6 
 
 		 319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  36.94 
 
 		 314 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  36.57 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  36.48 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  35.34 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 320 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2020  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257834  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 356 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3439  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.444229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 339 aa  139  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  30.79 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 315 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 315 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  32.58 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5165  transcriptional regulator, LysR family  31.21 
 
 		 324 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.83004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 333 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6408  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 316 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04629  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6646  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2000  transcriptional regulator, LysR family  32.77 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40236  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0898  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189766  normal  0.288462 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  34.24 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  32.24 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  32.03 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 313 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 341 aa  125  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0889  LysR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0704  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.271413  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0886  LysR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0376917  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5915  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2503  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3983  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 322 aa  123  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3572  transcriptional regulator, LysR family  36.8 
 
 		 322 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2069  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 326 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00114846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3178  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2539  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2608  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2632  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.724671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>