More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4394 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  604  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 351 aa  296  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 321 aa  189  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  38.82 
 
 		 321 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  37.38 
 
 		 325 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 320 aa  179  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5194  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 354 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  35.54 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 417 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  33.89 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 316 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 316 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  33.58 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 316 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2503  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 328 aa  145  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  33.81 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 339 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 356 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 320 aa  142  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  32.85 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 321 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1739  LysR substrate binding domain protein  29.67 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1803  LysR substrate binding domain-containing protein  29.67 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1532  LysR substrate binding domain protein  29.67 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1717  LysR substrate binding domain-containing protein  29.67 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0492643 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 317 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1743  LysR substrate binding domain protein  29.67 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.574272 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38270  pca operon transcription factor PcaQ  31.45 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 317 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2027  transcriptional regulator, LysR family  28.33 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.294769  hitchhiker  0.0000000175537 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1964  LysR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1601  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1504  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 313 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2237  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 339 aa  136  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956085 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1647  transcriptional regulator, LysR family  28.67 
 
 		 307 aa  136  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.997012  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1752  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 307 aa  136  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.53029e-17 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1366  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 481 aa  135  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 312 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3914  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 321 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01379  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2224  transcriptional regulator, LysR family  28 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1844  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01391  hypothetical protein  28 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3897  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6759  transcriptional regulator, LysR family  30.03 
 
 		 327 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04629  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 314 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2774  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 337 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0310  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 310 aa  132  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179801  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  33.09 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 419 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31260  Transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3111  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.55 
 
 		 300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 341 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 314 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  30.84 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0230  transcriptional regulator PcaQ  30.74 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0642  transcriptional regulator PcaQ  27.57 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3724  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2093  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 408 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  33.45 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 315 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>