More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3514 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 321 aa  637    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  63.43 
 
 		 315 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  62.01 
 
 		 315 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 315 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  49.31 
 
 		 299 aa  265  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  46.31 
 
 		 304 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  43.79 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 331 aa  250  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  42.9 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 316 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 316 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 316 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 316 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 316 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  45 
 
 		 314 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  43.42 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 317 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  44.67 
 
 		 314 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  40.92 
 
 		 339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  36.72 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  41.2 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  41.52 
 
 		 315 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 314 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  36.05 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 323 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  41.39 
 
 		 317 aa  179  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 318 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  34.43 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 332 aa  175  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  33.55 
 
 		 302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  37.32 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  35.12 
 
 		 327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 310 aa  162  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 319 aa  162  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 321 aa  162  9e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 305 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  33.88 
 
 		 325 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  29.69 
 
 		 334 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1141  transcriptional regulator  43.16 
 
 		 319 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  33.97 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 306 aa  148  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  29.25 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4103  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348034 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4472  LysR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 419 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3202  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 397 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3178  LysR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2539  LysR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4461  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 417 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2023  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2516  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 397 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>