More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5141 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 320 aa  653    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  61.08 
 
 		 341 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  61.02 
 
 		 325 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  59.62 
 
 		 321 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5194  LysR family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 354 aa  342  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  48.38 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 306 aa  179  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 316 aa  165  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 304 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  31.68 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  28.48 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  30.62 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  27.99 
 
 		 302 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 316 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  30.48 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 314 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  28.76 
 
 		 319 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  29.61 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 310 aa  133  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  30.82 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2686  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  29.66 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 328 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 313 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3914  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3439  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.444229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3707  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0214669 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  28.95 
 
 		 302 aa  126  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3811  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 426 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.310651 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6408  transcriptional regulator, LysR family  27.33 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0229  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 306 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 320 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4822  LysR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3344  LysR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0604334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4846  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5423  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0829573  normal  0.0352079 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5439  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 319 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 419 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 307 aa  123  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2910  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0377  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2110  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1495  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0475  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1807  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0793  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  28.16 
 
 		 334 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5247  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0614606  normal  0.32448 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4027  LysR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4171  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3495  LysR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3348  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0103811 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03234  transcriptional regulator  29.77 
 
 		 435 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5236  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4764  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1518  transcriptional regulator, LysR family  29.74 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4103  LysR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 316 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1826  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 316 aa  119  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0150451  hitchhiker  0.00784297 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  27.87 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>