More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3348 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3348  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  609  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0103811 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4764  LysR family transcriptional regulator  95.1 
 
 		 306 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5307  LysR family transcriptional regulator  94.77 
 
 		 306 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0037216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0229  LysR family transcriptional regulator  92.81 
 
 		 306 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4846  LysR family transcriptional regulator  92.16 
 
 		 306 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5423  LysR family transcriptional regulator  92.16 
 
 		 306 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0829573  normal  0.0352079 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5439  LysR family transcriptional regulator  92.16 
 
 		 306 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0475  LysR family transcriptional regulator  82.55 
 
 		 299 aa  497  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2110  LysR family transcriptional regulator  82.55 
 
 		 299 aa  497  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1495  LysR family transcriptional regulator  82.55 
 
 		 299 aa  497  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1807  LysR family transcriptional regulator  82.55 
 
 		 299 aa  497  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0377  LysR family transcriptional regulator  82.55 
 
 		 299 aa  497  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0793  LysR family transcriptional regulator  82.55 
 
 		 299 aa  497  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5936  transcriptional regulator, LysR family  77.29 
 
 		 302 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2130  LysR family transcriptional regulator  81.18 
 
 		 190 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2910  LysR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5236  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3344  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 329 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0604334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4822  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 329 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4171  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1826  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 316 aa  162  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0150451  hitchhiker  0.00784297 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.44 
 
 		 298 aa  159  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.78 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1518  transcriptional regulator, LysR family  35.57 
 
 		 316 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4432  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 300 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3970  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 300 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2599  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 319 aa  152  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5758  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0665563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1299  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4546  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.471439  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3822  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.563678  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2956  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4103  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3700  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0546971  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0218  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2711  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0957  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0296  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1940  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2168  transcriptional regulator, LysR family  32.09 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1244  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2219  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0206  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1663  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2585  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 306 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6604  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5159  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3555  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 302 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1408  transcriptional regulator, LysR family  31.61 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0263821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3819  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.37605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1450  transcriptional regulator, LysR family  32.01 
 
 		 305 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.756367  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.95 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1765  LysR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.95 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.95 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  27.95 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  27.95 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.95 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6318  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5141  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.730925 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6018  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.95 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.95 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0222  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 307 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4199  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.51 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7090  transcriptional regulator, LysR family  34.16 
 
 		 306 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5811  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 303 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.61 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3205  LysR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0988994 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26270  putative transcriptional regulator  34.81 
 
 		 329 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.338283  normal  0.903696 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0947  LysR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0207  LysR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 306 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4197  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 310 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5895  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 304 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0445545 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6670  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 311 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1301  transcriptional regulator, LysR family  31.99 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.828365  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7451  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5134  LysR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  0.868057 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0068  transcriptional regulator, LysR family  29.53 
 
 		 318 aa  116  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0795  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.556779 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4768  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5515  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3599  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601039  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0146  transcriptional regulator, LysR family  32.49 
 
 		 296 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6961  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 316 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3287  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4505  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 308 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5417  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.826157  normal  0.396347 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0254  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 306 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.56957 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2569  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0243965  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0528  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454001 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1757  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233098  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1067  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0986  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1910  OsmT protein  31.69 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1735  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0864805  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0180  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000907778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>