More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0145 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  608  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  67.99 
 
 		 313 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  62.95 
 
 		 314 aa  362  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  61.97 
 
 		 314 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  62.62 
 
 		 314 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  62.62 
 
 		 314 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  60 
 
 		 314 aa  333  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  39.74 
 
 		 302 aa  231  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  45.18 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  45.18 
 
 		 304 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 316 aa  172  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 316 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 331 aa  159  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  34.67 
 
 		 331 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 316 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  32.57 
 
 		 325 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 317 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 320 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0889  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0886  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0376917  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  35.61 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0704  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.271413  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2503  LysR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  35.61 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2632  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.724671  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 314 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0644  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0772357  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0345  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  31.86 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  33.77 
 
 		 319 aa  139  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  34.44 
 
 		 299 aa  139  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2479  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0092  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0215492  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 333 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 321 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5915  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2608  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2584  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0798399  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1974  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  34.16 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 339 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  31.65 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5165  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.83004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0898  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189766  normal  0.288462 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 417 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  32.38 
 
 		 315 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 328 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1803  LysR substrate binding domain-containing protein  31.23 
 
 		 307 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1743  LysR substrate binding domain protein  31.23 
 
 		 307 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.574272 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1739  LysR substrate binding domain protein  31.23 
 
 		 307 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1717  LysR substrate binding domain-containing protein  31.23 
 
 		 307 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0492643 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1532  LysR substrate binding domain protein  31.23 
 
 		 307 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 315 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2000  transcriptional regulator, LysR family  29.97 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40236  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0713  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.411699 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1964  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 307 aa  125  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  34.9 
 
 		 314 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 323 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2027  transcriptional regulator, LysR family  29.24 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.294769  hitchhiker  0.0000000175537 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 316 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31260  Transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 397 aa  123  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1752  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.53029e-17 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1504  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 307 aa  123  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1601  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 307 aa  123  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2237  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 339 aa  122  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956085 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2224  transcriptional regulator, LysR family  29.24 
 
 		 307 aa  122  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1844  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5938  transcriptional regulator, LysR family  29.04 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.254792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>