More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0889 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0889  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 338 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0704  LysR family transcriptional regulator  94.69 
 
 		 338 aa  634    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.271413  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0886  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 338 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0376917  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0345  LysR family transcriptional regulator  97.93 
 
 		 332 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0644  LysR family transcriptional regulator  97.93 
 
 		 332 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0772357  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0092  LysR family transcriptional regulator  97.7 
 
 		 298 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0215492  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2479  LysR family transcriptional regulator  97.7 
 
 		 298 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5915  LysR family transcriptional regulator  83.44 
 
 		 303 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0713  LysR family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 328 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.411699 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2503  LysR family transcriptional regulator  83.11 
 
 		 306 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2608  LysR family transcriptional regulator  82.45 
 
 		 303 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2584  LysR family transcriptional regulator  82.12 
 
 		 303 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0798399  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1974  LysR family transcriptional regulator  82.12 
 
 		 303 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2632  LysR family transcriptional regulator  82.12 
 
 		 306 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.724671  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2000  transcriptional regulator, LysR family  72 
 
 		 299 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40236  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6156  LysR family transcriptional regulator  65.67 
 
 		 308 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1678  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5051  LysR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443716  normal  0.966436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3275  transcriptional regulator, LysR family  30.95 
 
 		 300 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0115346  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3111  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.29 
 
 		 300 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5583  transcriptional regulator, LysR family  34.46 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0720  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8309  transcriptional regulator, LysR family  31.63 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4199  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.85 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.42 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5902  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 307 aa  123  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.52 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 290 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.23 
 
 		 302 aa  119  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 302 aa  119  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  31.23 
 
 		 302 aa  119  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.23 
 
 		 302 aa  119  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.23 
 
 		 302 aa  119  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.23 
 
 		 302 aa  119  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.23 
 
 		 302 aa  119  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.23 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 316 aa  119  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.23 
 
 		 302 aa  119  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  31.78 
 
 		 300 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1380  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6646  transcriptional regulator, LysR family  31.64 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636904 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2373  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0629728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3176  LysR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2069  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00114846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  31.33 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4836  LysR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5159  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1848  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  31.76 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  32.26 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  31.36 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2910  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 309 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3344  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 329 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0604334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2790  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 309 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4822  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 329 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 320 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 331 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5236  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2781  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4171  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  28.09 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5417  LysR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.826157  normal  0.396347 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04629  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1504  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1601  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5247  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2237  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956085 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1752  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.53029e-17 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  24.16 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01379  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.82 
 
 		 307 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2224  transcriptional regulator, LysR family  29.82 
 
 		 307 aa  107  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1844  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3660  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 295 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3700  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 332 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0546971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01391  hypothetical protein  29.82 
 
 		 307 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  23.26 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1282  LysR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1647  transcriptional regulator, LysR family  29.09 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.997012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>