More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0713 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0713  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 328 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.411699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5915  LysR family transcriptional regulator  91.06 
 
 		 303 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2503  LysR family transcriptional regulator  90.37 
 
 		 306 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2584  LysR family transcriptional regulator  90.4 
 
 		 303 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0798399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2608  LysR family transcriptional regulator  90.7 
 
 		 303 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1974  LysR family transcriptional regulator  90.4 
 
 		 303 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2632  LysR family transcriptional regulator  89.7 
 
 		 306 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.724671  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0704  LysR family transcriptional regulator  76.47 
 
 		 338 aa  480  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.271413  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0886  LysR family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 338 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0376917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0889  LysR family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 338 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0644  LysR family transcriptional regulator  75.62 
 
 		 332 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0772357  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0345  LysR family transcriptional regulator  75.62 
 
 		 332 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2479  LysR family transcriptional regulator  78.15 
 
 		 298 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0092  LysR family transcriptional regulator  78.15 
 
 		 298 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0215492  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2000  transcriptional regulator, LysR family  72.67 
 
 		 299 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40236  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6156  LysR family transcriptional regulator  66.34 
 
 		 308 aa  391  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1678  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5051  LysR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 306 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443716  normal  0.966436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3275  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0115346  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0720  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 298 aa  145  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3111  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.02 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8309  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 313 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5583  transcriptional regulator, LysR family  34.64 
 
 		 299 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1848  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2373  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0629728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 326 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 316 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 314 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 314 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 314 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 314 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 316 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2069  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 326 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00114846 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.43 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.43 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.43 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.43 
 
 		 302 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.43 
 
 		 302 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.43 
 
 		 302 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.43 
 
 		 302 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  29.43 
 
 		 302 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5902  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5159  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 318 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4103  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2237  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956085 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1752  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.53029e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1601  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1504  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01379  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.92 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2224  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3970  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4432  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01391  hypothetical protein  30.92 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1299  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 300 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1647  transcriptional regulator, LysR family  30.15 
 
 		 307 aa  109  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.997012  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 316 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5417  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 302 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.826157  normal  0.396347 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1964  LysR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 307 aa  108  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.78 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2027  transcriptional regulator, LysR family  30.53 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.294769  hitchhiker  0.0000000175537 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4546  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.471439  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1532  LysR substrate binding domain protein  30.15 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1717  LysR substrate binding domain-containing protein  30.15 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0492643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1803  LysR substrate binding domain-containing protein  30.15 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1380  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1739  LysR substrate binding domain protein  30.15 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5758  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0665563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1743  LysR substrate binding domain protein  30.15 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.574272 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3822  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.563678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0222  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3205  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0988994 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  31.82 
 
 		 304 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1663  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 338 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  29.7 
 
 		 325 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0296  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 300 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1940  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 300 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0206  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 300 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1244  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 300 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0957  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 300 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2219  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 300 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 321 aa  105  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  29.78 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0475  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111111  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0218  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4199  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.4 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3176  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 304 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594001  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>