More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2584 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1974  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2584  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0798399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2608  LysR family transcriptional regulator  98.68 
 
 		 303 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5915  LysR family transcriptional regulator  96.37 
 
 		 303 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2503  LysR family transcriptional regulator  96.04 
 
 		 306 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2632  LysR family transcriptional regulator  95.05 
 
 		 306 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.724671  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0713  LysR family transcriptional regulator  90.4 
 
 		 328 aa  547  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.411699 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0704  LysR family transcriptional regulator  80.4 
 
 		 338 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.271413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0889  LysR family transcriptional regulator  82.12 
 
 		 338 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0886  LysR family transcriptional regulator  82.12 
 
 		 338 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0376917  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0345  LysR family transcriptional regulator  79.8 
 
 		 332 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2479  LysR family transcriptional regulator  79.8 
 
 		 298 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0092  LysR family transcriptional regulator  79.8 
 
 		 298 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0215492  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0644  LysR family transcriptional regulator  79.8 
 
 		 332 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0772357  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2000  transcriptional regulator, LysR family  74.67 
 
 		 299 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40236  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6156  LysR family transcriptional regulator  67.66 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5051  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443716  normal  0.966436 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1678  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3275  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0115346  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3111  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.27 
 
 		 300 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0720  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5583  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8309  transcriptional regulator, LysR family  32.86 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.47 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1848  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 314 aa  122  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5902  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2373  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0629728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4199  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.55 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.87 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3897  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 414 aa  113  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5417  LysR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.826157  normal  0.396347 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 316 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.52 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.52 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  28.52 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.52 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.52 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.52 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5159  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.52 
 
 		 302 aa  112  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2069  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00114846 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.81 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3700  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0546971  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4103  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2910  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 326 aa  109  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4432  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1366  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 481 aa  109  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3970  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1299  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5236  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 311 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4171  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 305 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1752  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.53029e-17 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1601  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3344  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0604334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1504  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4822  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2237  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  30.65 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01379  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.77 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2224  transcriptional regulator, LysR family  29.77 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1844  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5758  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0665563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  28.21 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4546  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.471439  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3822  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.563678  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01391  hypothetical protein  29.77 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1647  transcriptional regulator, LysR family  29.01 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.997012  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 351 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6272  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 316 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1244  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1380  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306362  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1940  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0206  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0957  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2219  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2027  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.294769  hitchhiker  0.0000000175537 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0296  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1964  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1739  LysR substrate binding domain protein  29.01 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1743  LysR substrate binding domain protein  29.01 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.574272 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0475  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111111  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1663  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1717  LysR substrate binding domain-containing protein  29.01 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0492643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1803  LysR substrate binding domain-containing protein  29.01 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>