More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8659 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 304 aa  603  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 321 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  41.89 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 316 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 316 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 316 aa  225  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 320 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 328 aa  222  7e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 		 319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 314 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 299 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 313 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 315 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  39.3 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 317 aa  190  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 		 331 aa  188  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 318 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  36.77 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 321 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 333 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  36.7 
 
 		 335 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 315 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 315 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 316 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 315 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 315 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 323 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2023  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 306 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2539  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 308 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 312 aa  162  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3178  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 317 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 308 aa  159  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  29.87 
 
 		 314 aa  152  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 317 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  35.04 
 
 		 304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3902  transcriptional regulator LysR family  29.37 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 313 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  32.56 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  31.8 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  34.31 
 
 		 304 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 341 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3439  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.444229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 417 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  30.45 
 
 		 334 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2069  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00114846 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4103  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 335 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5194  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 354 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2311  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283875 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5744  transcriptional regulator, LysR family  30.87 
 
 		 434 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0821476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>