More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2311 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2311  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 321 aa  643    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283875 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4196  LysR family transcriptional regulator  54.75 
 
 		 322 aa  359  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1642  transcriptional regulator, LysR family  54.75 
 
 		 322 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520921  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 316 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  30.49 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  34.3 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  33.94 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 320 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3439  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 311 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.444229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 320 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  29.04 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 325 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3489  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  27.63 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  30.22 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 314 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 314 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 314 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3983  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  29.29 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  29.29 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2686  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 303 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5511  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.78 
 
 		 345 aa  99  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 323 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5194  LysR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  26.85 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 322 aa  97.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3964  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 315 aa  96.3  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0923381  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 315 aa  96.3  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3495  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 328 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563303 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  29.56 
 
 		 302 aa  95.9  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4160  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.181035 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5165  transcriptional regulator, LysR family  28.12 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.83004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  28.03 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4027  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0562  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260746  normal  0.122148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0898  LysR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189766  normal  0.288462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 323 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 315 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2482  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 303 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086853  normal  0.0180215 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  26.62 
 
 		 315 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2501  LysR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 322 aa  92.4  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 315 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3914  LysR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1440  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.65 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  29.21 
 
 		 303 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  24.25 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4635  LysR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 318 aa  90.1  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2663  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1225  LysR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 306 aa  89.7  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2093  LysR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 408 aa  89.4  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0276  transcriptional regulator, LysR family  28.48 
 
 		 295 aa  89.4  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265614 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4461  LysR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0642  transcriptional regulator PcaQ  25.25 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3902  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3202  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 397 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2104  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136552 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0604  pca operon transcription factor PcaQ  25.25 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  27.57 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>