More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5511 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5511  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  100 
 
 		 345 aa  686    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 306 aa  108  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3964  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0923381  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  26.25 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6408  transcriptional regulator, LysR family  30.57 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 312 aa  99.4  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2311  LysR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5165  transcriptional regulator, LysR family  29.08 
 
 		 324 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.83004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 314 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  26.99 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1642  transcriptional regulator, LysR family  26.71 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520921  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 328 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0898  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189766  normal  0.288462 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  27.37 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 321 aa  97.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4033  putative LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 326 aa  96.7  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.652401 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 314 aa  96.3  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1826  LysR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0150451  hitchhiker  0.00784297 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  27.84 
 
 		 299 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5542  transcriptional regulator, LysR family  28.4 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0196792  hitchhiker  0.00000723817 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 326 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4196  LysR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 322 aa  94.4  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 314 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 331 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 318 aa  94  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  26.95 
 
 		 304 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  26.95 
 
 		 304 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1527  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 326 aa  92.8  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.607461 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 308 aa  92.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4677  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 343 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0483253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2252  transcriptional regulator, LysR family  26.17 
 
 		 296 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  29.92 
 
 		 302 aa  90.1  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2149  transcriptional regulator, LysR family  29.15 
 
 		 294 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1124  LysR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3707  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0214669 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4012  putative LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  26.62 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  32.43 
 
 		 294 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3638  LysR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000174199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 317 aa  88.6  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6646  transcriptional regulator, LysR family  25.99 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636904 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4103  LysR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  22.93 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0507  LysR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 384 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1663  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3819  LysR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 316 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.37605 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 332 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  23.57 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03707  DNA-binding transcriptional activator, homocysteine-binding  29.9 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4151  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4052  transcriptional regulator MetR  29.9 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 294 aa  87  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4180  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0851648 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03656  hypothetical protein  29.9 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5269  transcriptional regulator MetR  29.9 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.213002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0805  transcriptional regulator, LysR family  34.29 
 
 		 297 aa  87  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 294 aa  87  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0551  LysR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 300 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.863373 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4348  transcriptional regulator MetR  29.9 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 317 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2516  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 397 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3344  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 329 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0604334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2910  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 309 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1380  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 309 aa  86.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0206  LysR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 300 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4822  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 329 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0296  LysR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 300 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 321 aa  86.3  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3572  transcriptional regulator, LysR family  31.35 
 
 		 322 aa  86.3  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4119  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 392 aa  85.9  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  23.51 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0094  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  28.33 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5931  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145733  normal  0.0470213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>