More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1527 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1527  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 326 aa  653    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.607461 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5165  transcriptional regulator, LysR family  90.51 
 
 		 324 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.83004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0898  LysR family transcriptional regulator  81.42 
 
 		 324 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189766  normal  0.288462 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6408  transcriptional regulator, LysR family  48.52 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6646  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 316 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636904 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  26.57 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  31.92 
 
 		 313 aa  132  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  31.49 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 356 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  29.51 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  31.38 
 
 		 304 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  32.15 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  35.89 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  28.87 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4205  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  29.49 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3234  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.58 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.842433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 316 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3724  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 304 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5511  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.98 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1535  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.6 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.195582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  27.7 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0642  transcriptional regulator PcaQ  26.94 
 
 		 302 aa  103  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0720  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0604  pca operon transcription factor PcaQ  26.94 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2311  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  28.53 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7076  transcriptional regulator, LysR family  27.39 
 
 		 305 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4461  LysR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2503  LysR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2851  transcriptional regulator, LysR family  29.72 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5606  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.71 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6793  transcriptional regulator, LysR family  28.71 
 
 		 319 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5938  transcriptional regulator, LysR family  27.15 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.254792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 314 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 331 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 326 aa  99.8  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2632  LysR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.724671  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  30.22 
 
 		 319 aa  99.8  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 328 aa  99.4  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5902  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 307 aa  99.4  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0889  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3111  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.45 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6156  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5915  LysR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0704  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 338 aa  98.2  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.271413  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0886  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0376917  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  28.12 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  30.17 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3275  transcriptional regulator, LysR family  27.1 
 
 		 300 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0115346  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2663  LysR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3386  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.34 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4781  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.34 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.749024  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4130  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.34 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.717557 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  28.34 
 
 		 321 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3964  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0923381  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2093  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 408 aa  96.3  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.26 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  28.26 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  28.26 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3239  DNA-binding transcriptional activator TdcA  24.58 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2000  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40236  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37940  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.19 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000278966  normal  0.0117616 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3495  LysR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>