More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2435 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 318 aa  652    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  97.35 
 
 		 302 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  41.72 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 314 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 314 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  41.72 
 
 		 304 aa  208  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 314 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 314 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 317 aa  155  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 312 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 314 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  33.83 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  32.77 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  34.22 
 
 		 313 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 315 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 317 aa  142  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 320 aa  142  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 314 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 317 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  31.3 
 
 		 334 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 318 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3914  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6408  transcriptional regulator, LysR family  28.82 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  28.99 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 308 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 314 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4160  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.181035 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5938  transcriptional regulator, LysR family  27.7 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.254792 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  28.81 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 417 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04629  transcriptional regulator  27.56 
 
 		 328 aa  129  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0898  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 324 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189766  normal  0.288462 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5165  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.83004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0562  LysR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260746  normal  0.122148 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2311  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283875 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7076  transcriptional regulator, LysR family  27.7 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5744  transcriptional regulator, LysR family  29.27 
 
 		 434 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0821476  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 356 aa  126  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4205  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  30.15 
 
 		 335 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1856  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal  0.189017 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1440  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  31.08 
 
 		 319 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4463  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 317 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 315 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 315 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  29.49 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  27.52 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3439  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.444229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 419 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 326 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 315 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 325 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  28.88 
 
 		 315 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 369 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>