More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0331 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 417 aa  824    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1366  LysR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 481 aa  292  7e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 415 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 419 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3811  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 426 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.310651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3922  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 417 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3897  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 414 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2093  LysR family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 408 aa  242  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31260  Transcriptional regulator, LysR family  38.72 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3202  LysR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 397 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3891  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 400 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5744  transcriptional regulator, LysR family  40.1 
 
 		 434 aa  236  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0821476  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2516  LysR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 397 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03234  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 435 aa  230  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0094  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  39.48 
 
 		 411 aa  227  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0095  LysR family substrate binding transcriptional regulator  39.48 
 
 		 411 aa  227  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2029  LysR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 397 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4119  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 392 aa  223  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3707  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 406 aa  216  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0214669 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2816  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0493129  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3271  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 421 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3543  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0643746  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 328 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  36.79 
 
 		 325 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 306 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 316 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  35.93 
 
 		 319 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 331 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  35.53 
 
 		 321 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 316 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  35.99 
 
 		 331 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 316 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 341 aa  140  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 320 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0507  LysR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 321 aa  136  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  33.93 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0338  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5938  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 305 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.254792 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 316 aa  132  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  29.51 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4205  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 316 aa  131  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 318 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 333 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 321 aa  130  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7076  transcriptional regulator, LysR family  32.17 
 
 		 305 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  32.86 
 
 		 335 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5194  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 354 aa  129  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 313 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2774  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 337 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  32.97 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  31.35 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  31.35 
 
 		 314 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 313 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 315 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  30.48 
 
 		 315 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 326 aa  125  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 315 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 314 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 304 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  32.36 
 
 		 302 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 304 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 307 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1856  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 328 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal  0.189017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3914  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6759  transcriptional regulator, LysR family  30.97 
 
 		 327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  29.82 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 323 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 323 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3572  transcriptional regulator, LysR family  35.94 
 
 		 322 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 314 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6156  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0642  transcriptional regulator PcaQ  29.93 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0604  pca operon transcription factor PcaQ  29.93 
 
 		 302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 314 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4033  putative LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.652401 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 322 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 314 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>