More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0094 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_4119  LysR family transcriptional regulator  99.74 
 
 
392 aa  790    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0094  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  100 
 
 
411 aa  833    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0095  LysR family substrate binding transcriptional regulator  99.51 
 
 
411 aa  830    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2093  LysR family transcriptional regulator  56.5 
 
 
408 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31260  Transcriptional regulator, LysR family  47.97 
 
 
397 aa  354  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3202  LysR family transcriptional regulator  47.85 
 
 
397 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2516  LysR family transcriptional regulator  47.59 
 
 
397 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2029  LysR family transcriptional regulator  47.59 
 
 
397 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  44.36 
 
 
415 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
419 aa  317  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5744  transcriptional regulator, LysR family  43.98 
 
 
434 aa  279  7e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0821476  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3707  LysR family transcriptional regulator  40.15 
 
 
406 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0214669 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  39.48 
 
 
417 aa  227  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3897  LysR family transcriptional regulator  33.25 
 
 
414 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1366  LysR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
481 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3922  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
404 aa  182  9.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2816  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0493129  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3891  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
400 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03234  transcriptional regulator  29.06 
 
 
435 aa  149  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3811  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
426 aa  143  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.310651 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3271  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 
421 aa  132  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
316 aa  122  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  29.73 
 
 
325 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  30.96 
 
 
299 aa  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  30.67 
 
 
331 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 
306 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  26.55 
 
 
302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
320 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  26.35 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3724  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  27.74 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
316 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
316 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
316 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
351 aa  113  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5938  transcriptional regulator, LysR family  27.65 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.254792 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  29.19 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2774  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066556  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6759  transcriptional regulator, LysR family  29.7 
 
 
327 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4205  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
316 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
313 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  28.21 
 
 
314 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0642  transcriptional regulator PcaQ  27.46 
 
 
302 aa  110  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  27.37 
 
 
304 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
321 aa  109  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0338  LysR family transcriptional regulator  26.11 
 
 
410 aa  109  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0604  pca operon transcription factor PcaQ  27.46 
 
 
302 aa  109  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  27.84 
 
 
314 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7076  transcriptional regulator, LysR family  26.62 
 
 
305 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62251  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
316 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  27.61 
 
 
313 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5194  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
354 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6124  pca operon transcription factor PcaQ  27.27 
 
 
284 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0261121  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1964  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
307 aa  107  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 
323 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3572  transcriptional regulator, LysR family  27.76 
 
 
322 aa  106  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
320 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2027  transcriptional regulator, LysR family  27.51 
 
 
307 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.294769  hitchhiker  0.0000000175537 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1647  transcriptional regulator, LysR family  27.18 
 
 
307 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.997012  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2237  LysR family transcriptional regulator  27.51 
 
 
339 aa  104  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.956085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1601  LysR family transcriptional regulator  27.51 
 
 
307 aa  104  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
341 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1504  LysR family transcriptional regulator  27.51 
 
 
307 aa  104  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 
314 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1752  LysR family transcriptional regulator  27.51 
 
 
307 aa  104  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  1.53029e-17 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1856  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
328 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal  0.189017 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
307 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2711  LysR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
306 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2585  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
306 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01379  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.51 
 
 
307 aa  103  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2224  transcriptional regulator, LysR family  27.51 
 
 
307 aa  103  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1844  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01391  hypothetical protein  27.51 
 
 
307 aa  103  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4463  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 
317 aa  103  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3489  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
330 aa  103  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2168  transcriptional regulator, LysR family  25.99 
 
 
310 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  27.6 
 
 
320 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3543  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
419 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0643746  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  27.67 
 
 
304 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  26.57 
 
 
326 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
356 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  28.29 
 
 
314 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38270  pca operon transcription factor PcaQ  28.24 
 
 
310 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
322 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3914  LysR family transcriptional regulator  26.25 
 
 
321 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3891  LysR family transcriptional regulator  29.04 
 
 
305 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314742  normal  0.132364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2486  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 
296 aa  99.8  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3111  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.34 
 
 
300 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 
308 aa  99.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1717  LysR substrate binding domain-containing protein  26.86 
 
 
307 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0492643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1739  LysR substrate binding domain protein  26.86 
 
 
307 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1743  LysR substrate binding domain protein  26.86 
 
 
307 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.574272 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1803  LysR substrate binding domain-containing protein  26.86 
 
 
307 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1532  LysR substrate binding domain protein  26.86 
 
 
307 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>