More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2816 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2816  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 383 aa  738    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0493129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03234  transcriptional regulator  45.04 
 
 		 435 aa  296  5e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3543  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 419 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0643746  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3922  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 404 aa  248  9e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3891  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 400 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1366  LysR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 481 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3271  LysR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 421 aa  186  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3811  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.310651 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31260  Transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 397 aa  179  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5744  transcriptional regulator, LysR family  35.34 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0821476  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3897  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 414 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2093  LysR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 408 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0095  LysR family substrate binding transcriptional regulator  30.98 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0094  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  30.98 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3202  LysR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 397 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2516  LysR family transcriptional regulator  33.25 
 
 		 397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2029  LysR family transcriptional regulator  33.25 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 417 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 419 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3707  LysR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0214669 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4119  LysR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1262  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0948373  normal  0.0721838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1305  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 310 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111615  normal  0.494502 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4006  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00309329  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1713  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0202364 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0338  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.19 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.19 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.19 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.19 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  30.19 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.19 
 
 		 302 aa  112  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.19 
 
 		 302 aa  112  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2069  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00114846 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38270  pca operon transcription factor PcaQ  31.13 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  30.19 
 
 		 302 aa  111  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5938  transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.254792 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.81 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0642  transcriptional regulator PcaQ  27.85 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0604  pca operon transcription factor PcaQ  27.85 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6759  transcriptional regulator, LysR family  30.79 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3914  LysR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7076  transcriptional regulator, LysR family  28.76 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4205  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 316 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4199  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.63 
 
 		 298 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2686  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2774  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.22 
 
 		 298 aa  103  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.02 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1856  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 328 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal  0.189017 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2503  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 306 aa  100  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 369 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1380  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 309 aa  99.4  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3724  LysR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 304 aa  99.8  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2337  pca operon transcriptional activator PcaQ  26.92 
 
 		 309 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.269299  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2121  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.31 
 
 		 306 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.547513  normal  0.230532 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3489  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 330 aa  99.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6124  pca operon transcription factor PcaQ  29.67 
 
 		 284 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0261121  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0222  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 307 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1518  transcriptional regulator, LysR family  31.53 
 
 		 316 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  31.25 
 
 		 321 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 312 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 316 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  29.56 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  30.51 
 
 		 325 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2956  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 316 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3572  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 322 aa  94  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6604  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 315 aa  92.8  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3239  DNA-binding transcriptional activator TdcA  25.6 
 
 		 312 aa  92.4  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02985  DNA-binding transcriptional activator  25.6 
 
 		 312 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0585  transcriptional regulator, LysR family  25.6 
 
 		 312 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3436  DNA-binding transcriptional activator TdcA  24.91 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.716587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02936  hypothetical protein  25.6 
 
 		 312 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1803  LysR substrate binding domain-containing protein  28.06 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1532  LysR substrate binding domain protein  28.06 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4431  DNA-binding transcriptional activator TdcA  25.6 
 
 		 312 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0908114 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3414  DNA-binding transcriptional activator TdcA  25.6 
 
 		 312 aa  92  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1826  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 316 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0150451  hitchhiker  0.00784297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3306  DNA-binding transcriptional activator TdcA  25.6 
 
 		 312 aa  92  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180291  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1743  LysR substrate binding domain protein  28.06 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.574272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0626  LysR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 325 aa  92  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.284859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1739  LysR substrate binding domain protein  28.06 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3603  DNA-binding transcriptional activator TdcA  25.26 
 
 		 312 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.835154 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3592  DNA-binding transcriptional activator TdcA  25.6 
 
 		 312 aa  92  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1717  LysR substrate binding domain-containing protein  28.06 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0492643 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0580  DNA-binding transcriptional activator TdcA  25.6 
 
 		 312 aa  92  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3507  DNA-binding transcriptional activator TdcA  24.91 
 
 		 312 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3433  DNA-binding transcriptional activator TdcA  24.91 
 
 		 312 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3540  DNA-binding transcriptional activator TdcA  24.91 
 
 		 312 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0279339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4418  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 325 aa  90.1  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.43525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  29.23 
 
 		 299 aa  90.1  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>