More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3922 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3922  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 404 aa  817    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3891  LysR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3897  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 414 aa  256  6e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03234  transcriptional regulator  37.28 
 
 		 435 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2816  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0493129  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3271  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 421 aa  230  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1366  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 481 aa  222  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3202  LysR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2516  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5744  transcriptional regulator, LysR family  35.34 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0821476  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31260  Transcriptional regulator, LysR family  34.13 
 
 		 397 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  33.25 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2029  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 397 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3811  LysR family transcriptional regulator  32.36 
 
 		 426 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.310651 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 417 aa  206  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 419 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2093  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 408 aa  200  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3543  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 419 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0643746  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3707  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0214669 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0095  LysR family substrate binding transcriptional regulator  30.43 
 
 		 411 aa  182  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0094  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  30.43 
 
 		 411 aa  182  9.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4119  LysR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 392 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 369 aa  131  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0338  LysR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3572  transcriptional regulator, LysR family  28.98 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1856  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 328 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal  0.189017 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5938  transcriptional regulator, LysR family  26.9 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.254792 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3914  LysR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 321 aa  121  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  26.71 
 
 		 302 aa  120  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7076  transcriptional regulator, LysR family  25.86 
 
 		 305 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6759  transcriptional regulator, LysR family  26.28 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2774  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4205  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 318 aa  117  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 316 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 316 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  25.76 
 
 		 314 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 316 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 317 aa  114  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6604  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 315 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 316 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1440  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  27.24 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  27.92 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2686  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 308 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 316 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2121  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.57 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.547513  normal  0.230532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  25.42 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  25.65 
 
 		 304 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0626  LysR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 325 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.284859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 321 aa  109  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5417  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.826157  normal  0.396347 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1848  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 314 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4446  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.553142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  25.81 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6124  pca operon transcription factor PcaQ  25.93 
 
 		 284 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0261121  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5194  LysR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38270  pca operon transcription factor PcaQ  25.93 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01890  transcriptional regulator PcaQ  25.74 
 
 		 275 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.536002  normal  0.885717 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  27.62 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0310  LysR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179801  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  26.58 
 
 		 304 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  25.65 
 
 		 304 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 306 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 315 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4006  LysR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 310 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00309329  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2337  pca operon transcriptional activator PcaQ  25.81 
 
 		 309 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.269299  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 314 aa  106  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0507  LysR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2503  LysR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5811  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638559  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  26.83 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1262  LysR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0948373  normal  0.0721838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  27.18 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1713  LysR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0202364 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1717  LysR substrate binding domain-containing protein  27.21 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0492643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1739  LysR substrate binding domain protein  27.21 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1532  LysR substrate binding domain protein  27.21 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1743  LysR substrate binding domain protein  27.21 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.574272 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1803  LysR substrate binding domain-containing protein  27.21 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04629  transcriptional regulator  26.19 
 
 		 328 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 313 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  25.5 
 
 		 314 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0230  transcriptional regulator PcaQ  25.5 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1305  LysR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111615  normal  0.494502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>