More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3176 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 334 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  91.94 
 
 		 335 aa  627  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4472  LysR family transcriptional regulator  62.78 
 
 		 326 aa  381  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4103  LysR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 308 aa  223  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3902  transcriptional regulator LysR family  37.46 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 316 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 331 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 316 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 312 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 319 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 320 aa  179  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  32.8 
 
 		 325 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  33.01 
 
 		 314 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 316 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  32.98 
 
 		 302 aa  149  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  29.37 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 339 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 321 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 318 aa  142  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  30.63 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 318 aa  139  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 302 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  30.45 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  26.14 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 314 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 312 aa  132  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 306 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 315 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  28.48 
 
 		 335 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  29.28 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 315 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 315 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 318 aa  123  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 313 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 320 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2069  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00114846 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 322 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  28.34 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  25.93 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 313 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3495  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563303 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4027  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5236  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4432  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3970  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0222  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5811  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 303 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638559  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6646  transcriptional regulator, LysR family  29.14 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 313 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 341 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 307 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4546  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.471439  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3822  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.563678  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5758  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0665563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1299  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4461  LysR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4635  LysR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 318 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  28.19 
 
 		 321 aa  106  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>