More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5807 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  99.68 
 
 		 315 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  95.87 
 
 		 315 aa  597  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  95.25 
 
 		 316 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  94.94 
 
 		 316 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  65.05 
 
 		 318 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 339 aa  344  8.999999999999999e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 332 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  37.54 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 314 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  36.52 
 
 		 304 aa  172  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  34.32 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  31.35 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 310 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2023  LysR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  32.45 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 315 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2539  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  32.64 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3178  LysR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 323 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 331 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 319 aa  139  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 351 aa  135  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  30.54 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 313 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 339 aa  132  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 315 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  27.33 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  27.85 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  28.96 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  29.31 
 
 		 319 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  29.07 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  29.47 
 
 		 331 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 318 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4103  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6646  transcriptional regulator, LysR family  28.74 
 
 		 316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636904 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  28.83 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 320 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 314 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  26.83 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5744  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0821476  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1440  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  31.34 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5194  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 354 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.215668 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  26.13 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1380  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5583  transcriptional regulator, LysR family  28.87 
 
 		 299 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3439  LysR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.444229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2373  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0629728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4472  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3964  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0923381  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 308 aa  106  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>