151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2353 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2353  galactose-binding protein regulator  100 
 
 		 138 aa  271  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1141  transcriptional regulator  97.1 
 
 		 319 aa  262  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  88.32 
 
 		 331 aa  236  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  72.99 
 
 		 316 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  72.99 
 
 		 316 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  72.26 
 
 		 316 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  72.26 
 
 		 316 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  71.53 
 
 		 316 aa  197  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  71.53 
 
 		 316 aa  194  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  71.53 
 
 		 316 aa  175  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  58.52 
 
 		 314 aa  158  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  55.64 
 
 		 319 aa  156  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 316 aa  156  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  55.64 
 
 		 314 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 320 aa  137  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  42.34 
 
 		 325 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 328 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 320 aa  110  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 321 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  35.34 
 
 		 302 aa  89  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  35.66 
 
 		 331 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 315 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 315 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 315 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 339 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  32.82 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 		 299 aa  72  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  29.03 
 
 		 304 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  29.32 
 
 		 334 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  31.5 
 
 		 314 aa  67.8  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 332 aa  67  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  32.31 
 
 		 335 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 417 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 417 aa  63.5  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4472  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3202  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2516  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 397 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  26.87 
 
 		 335 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 339 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 419 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  24.63 
 
 		 315 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2029  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 397 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 315 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 306 aa  60.1  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  30.09 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 315 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 313 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 315 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 315 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31260  Transcriptional regulator, LysR family  30.08 
 
 		 397 aa  57  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 313 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1856  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal  0.189017 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0640  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1305  LysR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111615  normal  0.494502 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 320 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  29.13 
 
 		 327 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  30.93 
 
 		 304 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1713  LysR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 310 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0202364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 317 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0310  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 310 aa  52  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179801  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 317 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3891  LysR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 400 aa  52  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0847  galactose-binding protein regulator  72.5 
 
 		 221 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4006  LysR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 310 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00309329  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2686  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 303 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 314 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  21.48 
 
 		 318 aa  51.6  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 369 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3897  LysR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 414 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 314 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 315 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2774  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 337 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066556  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 323 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 304 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 323 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 321 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2093  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 408 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 305 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1262  LysR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 310 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0948373  normal  0.0721838 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0218  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 300 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>