More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2771 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2771  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290913  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1431  transcriptional regulator, LysR family  65.36 
 
 		 301 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30963  normal  0.127714 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1472  transcriptional regulator, LysR family  65 
 
 		 301 aa  364  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  0.120322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2281  LysR family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 307 aa  295  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2148  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0402296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5250  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.79 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3549  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0241  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.94 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1368  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0323343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4677  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0483253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0270  putative transcriptional regulator  34.98 
 
 		 305 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54710  putative transcriptional regulator  37.37 
 
 		 304 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0282629  hitchhiker  0.000000212849 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0141  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0882865  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4326  transcriptional regulator, LysR family  33.01 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02390  putative transcriptional regulator  34.28 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.125777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4781  putative transcriptional regulator  37.72 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0215  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2634  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0212  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 311 aa  149  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08140  Transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24730  LysR family transcriptional regulator protein  36.24 
 
 		 317 aa  146  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08180  Transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 		 317 aa  146  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5754  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.39 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5002  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 304 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.415696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0234  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 304 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1982  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4525  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4388  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4431  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203311  normal  0.0207668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3429  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000037379  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5761  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 315 aa  125  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1834  transcriptional regulator, LysR family  31.74 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1434  transcriptional regulator, LysR family  31.74 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2959  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3174  LysR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2377  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2622  transcriptional regulator, LysR family  31.06 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.342108  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3202  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 397 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2516  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 397 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2029  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31260  Transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1355  transcriptional regulator, LysR family  29.35 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4014  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.993243 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2093  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 408 aa  95.9  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 289 aa  95.9  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4012  putative LysR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 317 aa  95.9  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4199  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.77 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 415 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 316 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.17 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2340  transcriptional regulator, LysR family  36.07 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5744  transcriptional regulator, LysR family  27.67 
 
 		 434 aa  92.8  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0821476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0066  oxidative stress regulatory protein OxyR, putative  34.43 
 
 		 307 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4542  LysR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 296 aa  92.4  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0164  LysR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.474897  normal  0.112541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5309  LysR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5218  LysR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4396  LysR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.20014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5357  LysR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.164156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48440  Transcriptional regulator, LysR family protein  32.42 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0556278  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 309 aa  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0037  transcriptional regulator, LysR family  35.52 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.279269  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0038  transcriptional regulator, LysR family  35.52 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.744574 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0639  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6121  putative transcriptional regulator  32.42 
 
 		 310 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70560  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 310 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0202  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.13 
 
 		 307 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1765  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 315 aa  89.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2844  LysR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 327 aa  89.4  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3718  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 308 aa  89  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0324  LysR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0489134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5558  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0095  LysR family substrate binding transcriptional regulator  25.84 
 
 		 411 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4119  LysR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 392 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0094  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  25.84 
 
 		 411 aa  88.6  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0103  transcriptional regulator, LysR family  32.26 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.4 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.4 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  27.4 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0377  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0475  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  33.81 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3275  transcriptional regulator, LysR family  30.53 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0115346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  27.4 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1495  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3111  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2110  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.4 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1807  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.4 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.4 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0793  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  39.06 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.4 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  26.73 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  30.13 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.77 
 
 		 298 aa  87  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  29.8 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>