More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1834 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1834  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 312 aa  637    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1434  transcriptional regulator, LysR family  95.19 
 
 		 318 aa  611  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2622  transcriptional regulator, LysR family  73.86 
 
 		 308 aa  479  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.342108  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1355  transcriptional regulator, LysR family  73.03 
 
 		 307 aa  473  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0215  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 314 aa  247  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08180  Transcriptional regulator, LysR family  44.23 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24730  LysR family transcriptional regulator protein  44.23 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5002  LysR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 304 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.415696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0234  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2634  transcriptional regulator, LysR family  39.74 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0141  transcriptional regulator, LysR family  39.23 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0882865  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4326  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0212  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02390  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 305 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.125777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0270  putative transcriptional regulator  37.79 
 
 		 305 aa  208  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4431  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203311  normal  0.0207668 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08140  Transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 320 aa  189  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1368  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0323343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54710  putative transcriptional regulator  36.91 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0282629  hitchhiker  0.000000212849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4781  putative transcriptional regulator  36.45 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4677  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0483253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1982  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2281  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2771  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290913  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5754  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.47 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2377  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 294 aa  112  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0241  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.09 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4014  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.993243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4525  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3429  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 315 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000037379  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1472  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 301 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  0.120322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3512  LysR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.069263  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1431  transcriptional regulator, LysR family  30.21 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30963  normal  0.127714 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3165  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 299 aa  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000392866  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5761  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1166  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02159  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1225  LysR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5250  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.77 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3549  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0811  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  26.82 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6374  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.436439 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4388  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6260  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2959  LysR family transcriptional regulator  26 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6662  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6427  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5626  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0807108 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0586  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.02 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6323  MarR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482978  normal  0.771209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3479  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35259  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6009  LysR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 322 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.853275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5523  transcriptional regulator, LysR family  28.08 
 
 		 322 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.553864 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2130  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  27.33 
 
 		 296 aa  99.4  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.809904  hitchhiker  0.00950877 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2148  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 317 aa  99  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0402296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0298  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.202952 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4982  LysR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 307 aa  96.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.960154 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0545  transcriptional regulator, LysR family  26.71 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1380  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0532  transcriptional regulator, LysR family  26.37 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3181  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3165  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.25 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0107  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.46 
 
 		 315 aa  93.2  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1242  LysR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 293 aa  93.2  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3174  LysR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2120  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 292 aa  92.4  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112359  normal  0.184045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4542  LysR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0528  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1352  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2001  transcriptional regulator, LysR family  26.92 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.536649 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  28.21 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4089  transcriptional regulator, LysR family  28.76 
 
 		 297 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3634  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.246418 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1695  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 300 aa  90.5  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  28.5 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0216  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  27.69 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 300 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  28.21 
 
 		 300 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 300 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 294 aa  89.4  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>