More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1982 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1982  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  604  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5754  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  76.82 
 
 		 305 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4525  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 300 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4014  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.993243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2377  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1472  transcriptional regulator, LysR family  36.43 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  0.120322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1431  transcriptional regulator, LysR family  36.07 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30963  normal  0.127714 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4388  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2148  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 317 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0402296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1368  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0323343 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0241  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.98 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2281  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2771  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290913  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54710  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0282629  hitchhiker  0.000000212849 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5761  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 315 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5250  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.26 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3549  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4781  putative transcriptional regulator  34.03 
 
 		 304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1434  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1834  transcriptional regulator, LysR family  30.93 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08140  Transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 320 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4677  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0483253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4431  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203311  normal  0.0207668 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02390  putative transcriptional regulator  30.83 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.125777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0270  putative transcriptional regulator  30.42 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0215  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2622  transcriptional regulator, LysR family  29.51 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.342108  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2634  transcriptional regulator, LysR family  29.3 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5002  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 304 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.415696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0212  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0141  transcriptional regulator, LysR family  29.58 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0882865  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4326  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0234  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08180  Transcriptional regulator, LysR family  29.97 
 
 		 317 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24730  LysR family transcriptional regulator protein  29.97 
 
 		 317 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3174  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1355  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0222  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 307 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2585  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 306 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2959  LysR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 306 aa  99  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2711  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08961  transcriptional regulator, LysR family protein  35.62 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4542  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2343  transcriptional regulator, LysR family  35.05 
 
 		 237 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988261  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3429  LysR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 315 aa  95.5  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000037379  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1599  transcriptional regulator, LysR family  32.49 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 296 aa  93.6  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  29.34 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1856  LysR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 328 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal  0.189017 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5811  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638559  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  26.07 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.07 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2774  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 337 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066556  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.07 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.07 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.07 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  26.07 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1225  LysR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 306 aa  89.7  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.07 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.07 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0107  DNA-binding transcriptional regulator CynR  34.72 
 
 		 315 aa  89  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  29.51 
 
 		 335 aa  89  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6759  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.21 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1765  LysR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  26.17 
 
 		 334 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1036  transcriptional regulator, LysR family  31.75 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0894  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 298 aa  86.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  29.38 
 
 		 294 aa  85.9  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3737  LysR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 292 aa  85.9  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.440992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0664  transcriptional regulator, LysR family  27.66 
 
 		 331 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2425  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.540189  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6604  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 315 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7208  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 293 aa  85.9  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2830  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 303 aa  85.5  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2380  transcriptional regulator, LysR family  27.66 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2168  transcriptional regulator, LysR family  31.64 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  34.05 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2454  LysR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332878  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2329  transcriptional regulator, LysR family  27.66 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0269  hypothetical protein  28.81 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0317  pca operon transcription factor PcaQ  32.46 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1735  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0449  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.206792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1759  Pca operon transcriptional activator PcaQ  32.46 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0219488  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1844  pca operon transcription factor PcaQ  32.46 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.282267  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1748  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.8769 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6344  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3811  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.310651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0720  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6323  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482978  normal  0.771209 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3386  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.71 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4130  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.71 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.717557 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4781  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.71 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.749024  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4535  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3939  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>