More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0449 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0449  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 317 aa  632  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.206792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3242  LysR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 301 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.783996  normal  0.606563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1033  LysR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 305 aa  275  7e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5460  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.54 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3922  LysR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 404 aa  98.2  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4655  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0129573  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2937  transcriptional regulator, LysR family  25.95 
 
 		 305 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0362  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3346  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4367  LysR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 309 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.764337  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2723  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.64 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.63808  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4199  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.53 
 
 		 298 aa  89.7  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2117  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.052237  normal  0.387945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2863  LysR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.97885  normal  0.374459 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3707  LysR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0214669 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5544  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3897  LysR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 414 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2701  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2919  LysR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.56 
 
 		 298 aa  87  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.08 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3422  transcriptional regulator, LysR family  30.73 
 
 		 302 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3051  LysR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2773  LysR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 305 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3086  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 312 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0147  LysR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 296 aa  85.9  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0144  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  27.75 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2617  OsmT protein  29.53 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1670  LysR substrate-binding protein  29.97 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.903503  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2789  OsmT protein  29.53 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2683  OsmT protein  29.53 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.567691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3722  transcriptional regulator, LysR family  30.24 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  30.47 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  36.05 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54710  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0282629  hitchhiker  0.000000212849 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2568  OsmT protein  29.53 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0008695  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0157  LysR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1907  transcriptional regulator  26.73 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1982  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1765  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3380  transcriptional regulator, LysR family  31.28 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3700  LysR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0546971  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4781  putative transcriptional regulator  28.22 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0828  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3441  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.985803  hitchhiker  0.000545962 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2659  OsmT protein  29.02 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.55 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  23.55 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.55 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38270  pca operon transcription factor PcaQ  30.58 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.55 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4468  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  23.55 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.55 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.54 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4616  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0613  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723423  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  31.22 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4119  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24730  LysR family transcriptional regulator protein  28.11 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4382  LysR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  29.38 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  37.84 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.37 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08180  Transcriptional regulator, LysR family  28.11 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0243  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 318 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0617  transcriptional regulator, LysR family  29.58 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0094  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  30.2 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0586  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.64 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2998  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.412337 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5159  LysR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0095  LysR family substrate binding transcriptional regulator  30.2 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  23.55 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1599  transcriptional regulator, LysR family  27.2 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0434  transcriptional regulator, LysR family  34.75 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351851  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3757  LysR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1743  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6604  LysR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1856  LysR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal  0.189017 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1581  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4205  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2509  LysR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123879  normal  0.290889 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08140  Transcriptional regulator, LysR family  26.74 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  24.23 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3891  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314742  normal  0.132364 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0521  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0634  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0961605  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1353  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5943  LysR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.180862 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1555  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.729092  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>