More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4382 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4382  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  589  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3652  transcriptional regulator, LysR family  78.72 
 
 		 301 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2975  LysR family transcriptional regulator  76.35 
 
 		 297 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819316  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3825  LysR family transcriptional regulator  45.15 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.363475 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2268  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  48.98 
 
 		 302 aa  265  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.170931  normal  0.112201 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2577  transcriptional regulator, LysR family  48.3 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216536  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4735  LysR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 305 aa  255  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3921  transcriptional regulator, LysR family  44.33 
 
 		 305 aa  255  8e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4035  transcriptional regulator, LysR family  44.33 
 
 		 305 aa  255  8e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.176512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4144  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1487  LysR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.235813  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2826  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 302 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123766 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3236  transcriptional regulator, LysR family  41.33 
 
 		 307 aa  241  7e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1568  LysR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 317 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1646  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4729  LysR family transcriptional regulator  44 
 
 		 317 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417319  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1507  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 317 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1591  LysR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 324 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0175342  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1765  transcriptional regulator, LysR family  45.02 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1111  LysR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0711  transcriptional regulator, LysR family  42.71 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1158  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1817  LysR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  hitchhiker  0.00360584 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1340  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875316  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1264  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 317 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0178  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 303 aa  225  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5122  transcriptional regulator, LysR family  43.54 
 
 		 298 aa  225  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2518  LysR family regulatory protein  41.84 
 
 		 311 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1656  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.68 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0778  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3118  transcriptional regulator, LysR family  37.97 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4153  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 299 aa  192  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2928  transcriptional regulator, LysR family  35.59 
 
 		 309 aa  191  9e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1674  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1720  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3501  transcriptional regulator, LysR family  37.04 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7374  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3122  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2216  transcriptional regulator, LysR family  37.72 
 
 		 311 aa  175  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2528  transcriptional regulator, LysR family  37.37 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3624  transcriptional regulator, LysR family  39.66 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1272  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 295 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1472  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4825  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.861271  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4492  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.957194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2041  transcriptional regulator, LysR family  33.08 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4202  transcriptional regulator, LysR family  31.76 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1722  LysR substrate-binding  32.69 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0793479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1092  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 301 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0509948  normal  0.0429857 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4570  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1679  transcriptional regulator, LysR family  33.59 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409194  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2416  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  28.57 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000387203  decreased coverage  0.000000509864 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5409  LysR family protein  34.33 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0963  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 334 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4662  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 329 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1293  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00171024  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3187  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5640  transcriptional regulator LysR family  31.76 
 
 		 300 aa  132  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2980  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1328  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3105  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1185  LysR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000537468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5647  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.287338 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5847  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5630  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0341867 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1590  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3711  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4657  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5280  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 318 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  30.26 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3548  transcriptional regulator LysR family  34.87 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0319  putative transcriptional regulator  30.18 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6370  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02870  putative transcriptional regulator  29.82 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238694 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0140  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3176  LysR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1259  transcriptional regulator, LysR family  32.38 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2287  nitrogen assimilation regulatory protein Nac, putative  32.89 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5289  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127771  normal  0.048203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5126  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 319 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  0.155944 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4986  LysR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 304 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.910518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0395  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 315 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662274 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3380  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.846396 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4630  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3526  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.57 
 
 		 301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.33739  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1615  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 299 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979938  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2072  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751025 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0513  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.810346  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1879  transcriptional regulator, LysR family  34.63 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0397318  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3501  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.829127  normal  0.0458146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6176  transcriptional regulator, LysR family  31.76 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 298 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0659  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 314 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1239  transcriptional regulator, LysR family  33.72 
 
 		 307 aa  112  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.138802  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5497  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315237  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1338  putative transcriptional regulator  30.2 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>