More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3526 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3526  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  100 
 
 		 301 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.33739  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1879  transcriptional regulator, LysR family  95.56 
 
 		 283 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0397318  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4986  LysR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 304 aa  261  8e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.910518 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4657  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5630  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0341867 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3711  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5847  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5647  LysR family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.287338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5497  transcriptional regulator, LysR family  44.11 
 
 		 316 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315237  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6370  LysR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5280  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5126  LysR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 319 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  0.155944 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3380  LysR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.846396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4825  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.861271  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5121  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.88 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6698  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6176  transcriptional regulator, LysR family  35.22 
 
 		 320 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1338  putative transcriptional regulator  38.54 
 
 		 311 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3263  LysR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266954  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15210  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.017601  hitchhiker  0.00000000286911 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3790  LysR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 307 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.98544 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1297  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2943  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3069  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 318 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227283  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2256  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 333 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1704  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 307 aa  185  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0659  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4299  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.09 
 
 		 302 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.941417  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1328  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 304 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2980  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 304 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3105  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 304 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4492  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.957194 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2287  nitrogen assimilation regulatory protein Nac, putative  31.89 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0513  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.810346  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4202  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 302 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1656  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.11 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4144  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 307 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2452  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2826  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3825  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.363475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1765  transcriptional regulator, LysR family  32.31 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0711  transcriptional regulator, LysR family  33.8 
 
 		 304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2577  transcriptional regulator, LysR family  30.17 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216536  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3757  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4662  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 329 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2268  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.17 
 
 		 302 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.170931  normal  0.112201 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3548  transcriptional regulator LysR family  33.44 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1487  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.235813  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3921  transcriptional regulator, LysR family  33.07 
 
 		 305 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1591  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 324 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0175342  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4035  transcriptional regulator, LysR family  33.07 
 
 		 305 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.176512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1111  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 317 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1507  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0140  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1568  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_003296  RS02127  transcriptional regulator transcription regulator protein  29.3 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0963  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1679  transcriptional regulator, LysR family  34.1 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409194  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5122  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2975  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 297 aa  126  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819316  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1646  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 317 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3652  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1293  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00171024  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3236  transcriptional regulator, LysR family  31.91 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4729  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417319  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1817  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  hitchhiker  0.00360584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4382  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5567  LysR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5640  transcriptional regulator LysR family  30.21 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4735  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3118  transcriptional regulator, LysR family  28.04 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1092  transcriptional regulator, LysR family  31.95 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0509948  normal  0.0429857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2041  transcriptional regulator, LysR family  31.7 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1264  LysR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 317 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1590  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1340  LysR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875316  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2416  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  26.37 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000387203  decreased coverage  0.000000509864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1722  LysR substrate-binding  31.32 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0793479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0178  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1272  LysR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1472  LysR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3756  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.231956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1720  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1259  transcriptional regulator, LysR family  28.27 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3624  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2518  LysR family regulatory protein  29.73 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5409  LysR family protein  30.19 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2928  transcriptional regulator, LysR family  26.35 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3501  transcriptional regulator, LysR family  31.17 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7374  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4570  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 298 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1158  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 301 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  30.65 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1185  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000537468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3176  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2216  transcriptional regulator, LysR family  30.35 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5425  Transcriptional regulator  29.55 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3501  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.829127  normal  0.0458146 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3715  LysR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1674  transcriptional regulator, LysR family  29.71 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>