More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4492 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4492  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 306 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.957194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4202  transcriptional regulator, LysR family  87.96 
 
 		 302 aa  507  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5640  transcriptional regulator LysR family  66.67 
 
 		 300 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3825  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.363475 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3236  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3526  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.37 
 
 		 301 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.33739  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4657  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3711  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5647  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.287338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3652  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5630  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0341867 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5847  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4144  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 307 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15210  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.017601  hitchhiker  0.00000000286911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1338  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 311 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1272  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1472  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2577  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216536  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0711  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4382  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2268  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.41 
 
 		 302 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.170931  normal  0.112201 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1656  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.39 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2826  LysR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123766 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4035  transcriptional regulator, LysR family  31.89 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.176512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0963  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 334 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3921  transcriptional regulator, LysR family  31.89 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1293  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 320 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00171024  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5409  LysR family protein  31.97 
 
 		 300 aa  139  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1259  transcriptional regulator, LysR family  34.91 
 
 		 300 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4570  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2975  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819316  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5497  transcriptional regulator, LysR family  31.51 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1879  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 283 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0397318  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0140  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 300 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1158  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3568  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4735  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 305 aa  129  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4629  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1092  transcriptional regulator, LysR family  33.58 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0509948  normal  0.0429857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0395  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0178  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4986  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.910518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4825  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.861271  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3187  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1765  transcriptional regulator, LysR family  32.94 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2041  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1704  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 307 aa  126  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1679  transcriptional regulator, LysR family  32.68 
 
 		 316 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409194  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3176  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 304 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5126  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  0.155944 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6698  LysR family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 310 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1568  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2943  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5122  transcriptional regulator, LysR family  35.38 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1297  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1590  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2256  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 333 aa  122  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3501  transcriptional regulator, LysR family  32.9 
 
 		 310 aa  122  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7374  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1507  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1591  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0175342  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1722  LysR substrate-binding  31.44 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0793479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4662  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 329 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2840  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1111  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3069  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227283  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1646  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0659  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1185  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000537468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6622  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.255489 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1487  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.235813  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3380  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.846396 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5121  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.67 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0548  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3548  transcriptional regulator LysR family  32.18 
 
 		 318 aa  119  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02870  putative transcriptional regulator  30.04 
 
 		 313 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238694 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2416  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  27.8 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000387203  decreased coverage  0.000000509864 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5280  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1817  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  hitchhiker  0.00360584 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6370  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5289  LysR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127771  normal  0.048203 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6218  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215178 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5851  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121988  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4729  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417319  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0319  putative transcriptional regulator  30.04 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2928  transcriptional regulator, LysR family  28.18 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6694  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6176  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 320 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3790  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.98544 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3624  transcriptional regulator, LysR family  32.03 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3263  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266954  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2452  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60115  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.97 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  30.97 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3715  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  30.97 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  25.51 
 
 		 295 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5425  Transcriptional regulator  31.31 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0369  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.97 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0778  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1720  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>