More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3568 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3568  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 312 aa  633  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1679  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409194  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1293  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 320 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00171024  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1590  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4662  transcriptional regulator, LysR family  34.98 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3548  transcriptional regulator LysR family  33.55 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3187  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 307 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6622  LysR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 318 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.255489 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4629  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 332 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6694  LysR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5851  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121988  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6218  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215178 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1472  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5409  LysR family protein  34.1 
 
 		 300 aa  133  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3501  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 304 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.829127  normal  0.0458146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0548  LysR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2072  transcriptional regulator, LysR family  31.71 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751025 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0319  putative transcriptional regulator  33.07 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02870  putative transcriptional regulator  31.87 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4492  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.957194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1239  transcriptional regulator, LysR family  31.7 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.138802  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4202  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3756  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.231956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0761  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.211674  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0907  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5425  Transcriptional regulator  30.58 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3236  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2416  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  30.67 
 
 		 297 aa  116  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000387203  decreased coverage  0.000000509864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3176  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3921  transcriptional regulator, LysR family  30.38 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4035  transcriptional regulator, LysR family  30.38 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.176512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5640  transcriptional regulator LysR family  30.71 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5126  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  0.155944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1722  LysR substrate-binding  33.08 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0793479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2041  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1185  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000537468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1272  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4144  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 307 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1092  transcriptional regulator, LysR family  32.95 
 
 		 301 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0509948  normal  0.0429857 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1656  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.37 
 
 		 321 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0178  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1817  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  hitchhiker  0.00360584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3825  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.363475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2975  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819316  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15210  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.017601  hitchhiker  0.00000000286911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1338  putative transcriptional regulator  27.48 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2826  LysR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123766 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7296  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343468  normal  0.377846 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4986  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.910518 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0223  transcriptional regulator, LysR family  28.9 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239924 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1264  LysR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1340  LysR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875316  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0395  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662274 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6370  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 309 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0711  transcriptional regulator, LysR family  25.95 
 
 		 304 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0778  LysR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5280  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2518  LysR family regulatory protein  32.96 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4382  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 300 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4825  LysR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.861271  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4735  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5121  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.32 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2118  LysR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0963  LysR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3652  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5847  LysR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0362  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.81 
 
 		 299 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0403  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.81 
 
 		 299 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5647  LysR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 302 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.287338 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4570  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.38 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  26.38 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  26.38 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3287  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.81 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5630  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0341867 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3711  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  27.12 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4657  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0369  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.81 
 
 		 299 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1259  transcriptional regulator, LysR family  29.86 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  22.62 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4153  LysR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 299 aa  90.5  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1769  LysR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 291 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0244764  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 307 aa  89.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6698  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 310 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2256  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 333 aa  89.7  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0140  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0659  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 314 aa  89.4  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0411  DNA-binding transcriptional regulator CynR  25.57 
 
 		 299 aa  89.4  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 292 aa  89  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  23.18 
 
 		 292 aa  89  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5497  transcriptional regulator, LysR family  25.69 
 
 		 316 aa  89  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1297  LysR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2943  LysR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6176  transcriptional regulator, LysR family  27.84 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1720  LysR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  22.42 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5122  transcriptional regulator, LysR family  27.3 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3526  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.08 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.33739  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4729  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417319  normal  0.651457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>