More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2518 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2518  LysR family regulatory protein  100 
 
 		 311 aa  630  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1340  LysR family transcriptional regulator  98.71 
 
 		 317 aa  624  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875316  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1264  LysR family transcriptional regulator  99.36 
 
 		 317 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1646  LysR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4729  LysR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417319  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1765  transcriptional regulator, LysR family  42.44 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1487  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 317 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.235813  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1568  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 317 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1111  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 317 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1591  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0175342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1507  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5122  transcriptional regulator, LysR family  42.76 
 
 		 298 aa  242  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1158  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4382  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0178  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 303 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3825  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 306 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.363475 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2268  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.39 
 
 		 302 aa  215  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.170931  normal  0.112201 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3652  transcriptional regulator, LysR family  43.25 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2928  transcriptional regulator, LysR family  39.53 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2577  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216536  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1817  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 310 aa  208  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  hitchhiker  0.00360584 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3118  transcriptional regulator, LysR family  41.54 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2975  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 297 aa  202  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819316  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1674  transcriptional regulator, LysR family  38.96 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4153  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4144  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1720  LysR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 304 aa  198  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4035  transcriptional regulator, LysR family  37.84 
 
 		 305 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.176512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3921  transcriptional regulator, LysR family  37.84 
 
 		 305 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2216  transcriptional regulator, LysR family  38.54 
 
 		 311 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2528  transcriptional regulator, LysR family  38 
 
 		 310 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4735  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 305 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1656  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.96 
 
 		 321 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3122  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0778  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 306 aa  189  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0711  transcriptional regulator, LysR family  35.15 
 
 		 304 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2826  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123766 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3501  transcriptional regulator, LysR family  40.43 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7374  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3624  transcriptional regulator, LysR family  39.57 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3236  transcriptional regulator, LysR family  33.77 
 
 		 307 aa  175  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1679  transcriptional regulator, LysR family  35.36 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409194  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1272  LysR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4662  transcriptional regulator, LysR family  34.63 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1722  LysR substrate-binding  36.67 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0793479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3548  transcriptional regulator LysR family  34.59 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1472  LysR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2041  transcriptional regulator, LysR family  36.25 
 
 		 301 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1092  transcriptional regulator, LysR family  35.83 
 
 		 301 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0509948  normal  0.0429857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5126  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 319 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  0.155944 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3176  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0395  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662274 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5409  LysR family protein  31.92 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4570  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5280  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2416  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  26.26 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000387203  decreased coverage  0.000000509864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1259  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0513  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.810346  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4825  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.861271  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5289  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 302 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127771  normal  0.048203 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0548  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2072  transcriptional regulator, LysR family  31.99 
 
 		 305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751025 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 305 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6370  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 309 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6694  LysR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 321 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32621 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3501  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 304 aa  122  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.829127  normal  0.0458146 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 298 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3187  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6622  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.255489 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5851  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121988  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6218  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215178 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0963  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 334 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5497  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315237  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2482  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086853  normal  0.0180215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1590  LysR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5108  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5523  transcriptional regulator, LysR family  30.28 
 
 		 322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.553864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4657  LysR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4629  transcriptional regulator, LysR family  29.91 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  25.97 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3711  LysR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1185  LysR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000537468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0140  LysR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5847  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  29.63 
 
 		 302 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5630  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 302 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0341867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0545  transcriptional regulator, LysR family  28.42 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  26.36 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5647  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.287338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1338  putative transcriptional regulator  27.06 
 
 		 311 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1293  LysR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 320 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00171024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15210  LysR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.017601  hitchhiker  0.00000000286911 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4299  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.27 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.941417  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4202  transcriptional regulator, LysR family  31.51 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5626  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0807108 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  31.53 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>