More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4202 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4202  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 302 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4492  transcriptional regulator, LysR family  87.96 
 
 		 306 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.957194 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5640  transcriptional regulator LysR family  63.21 
 
 		 300 aa  378  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3526  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.95 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.33739  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4144  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3825  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.363475 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3236  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1656  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.89 
 
 		 321 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1293  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00171024  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5630  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0341867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3652  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5409  LysR family protein  34.34 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3711  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 302 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4657  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 302 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0711  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5647  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.287338 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5847  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4382  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 300 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1272  LysR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 295 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2975  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819316  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1472  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2577  transcriptional regulator, LysR family  31.38 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216536  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5497  transcriptional regulator, LysR family  32.32 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315237  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1338  putative transcriptional regulator  31.88 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15210  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.017601  hitchhiker  0.00000000286911 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4035  transcriptional regulator, LysR family  32.81 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.176512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3921  transcriptional regulator, LysR family  32.81 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1879  transcriptional regulator, LysR family  37.1 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0397318  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2826  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 302 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123766 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0963  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 334 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1092  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0509948  normal  0.0429857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2268  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.38 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.170931  normal  0.112201 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4986  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.910518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4825  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.861271  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2416  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  30.63 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000387203  decreased coverage  0.000000509864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1185  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000537468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3568  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 312 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4570  LysR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 298 aa  133  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2840  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1158  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0178  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1297  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2041  transcriptional regulator, LysR family  32.58 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2943  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1590  LysR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2256  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1679  transcriptional regulator, LysR family  32.3 
 
 		 316 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409194  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3069  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227283  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1765  transcriptional regulator, LysR family  32.39 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5122  transcriptional regulator, LysR family  35.88 
 
 		 298 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1507  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0319  putative transcriptional regulator  30.5 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0548  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1568  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1259  transcriptional regulator, LysR family  32.33 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02870  putative transcriptional regulator  30.14 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4735  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1722  LysR substrate-binding  32.2 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0793479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1487  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 317 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.235813  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6622  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 318 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.255489 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1646  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 317 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0140  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1111  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 317 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1591  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 324 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0175342  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3548  transcriptional regulator LysR family  32.95 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5126  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  0.155944 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4629  transcriptional regulator, LysR family  32.28 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0395  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662274 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3176  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3187  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3380  LysR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.846396 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4662  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5121  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.33 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6698  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4729  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417319  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6218  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215178 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5851  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121988  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5280  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6370  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1704  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 307 aa  119  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3287  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.58 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.82 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  32.82 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0403  DNA-binding transcriptional regulator CynR  33.21 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0411  DNA-binding transcriptional regulator CynR  33.21 
 
 		 299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0362  DNA-binding transcriptional regulator CynR  33.21 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3501  transcriptional regulator, LysR family  31.25 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7374  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6694  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32621 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3756  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.231956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  32.82 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1817  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  hitchhiker  0.00360584 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1264  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2928  transcriptional regulator, LysR family  29.64 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1340  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875316  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0369  DNA-binding transcriptional regulator CynR  32.82 
 
 		 299 aa  116  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2070  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518674  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3624  transcriptional regulator, LysR family  31.7 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0778  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2518  LysR family regulatory protein  27.8 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>