More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5280 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5280  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 318 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6370  LysR family transcriptional regulator  88.67 
 
 		 309 aa  568  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4986  LysR family transcriptional regulator  53.67 
 
 		 304 aa  347  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.910518 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5847  LysR family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 302 aa  338  7e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4657  LysR family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 302 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3711  LysR family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 302 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5647  LysR family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 302 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.287338 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5630  LysR family transcriptional regulator  52.65 
 
 		 302 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0341867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5126  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 319 aa  295  8e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  0.155944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5497  transcriptional regulator, LysR family  44.77 
 
 		 316 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315237  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3526  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  44.37 
 
 		 301 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.33739  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3069  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 318 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2943  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 326 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1297  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3380  LysR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.846396 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2256  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1879  transcriptional regulator, LysR family  43.92 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0397318  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6176  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 		 320 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5121  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.93 
 
 		 306 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6698  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 310 aa  198  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1338  putative transcriptional regulator  34.25 
 
 		 311 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3790  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.98544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15210  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.017601  hitchhiker  0.00000000286911 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3263  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266954  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1704  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0659  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 314 aa  179  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4825  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.861271  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4299  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.58 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.941417  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3757  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 321 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0140  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3825  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 306 aa  149  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.363475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1272  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 295 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5567  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3236  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02127  transcriptional regulator transcription regulator protein  27.8 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2287  nitrogen assimilation regulatory protein Nac, putative  31.51 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1328  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3105  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0513  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.810346  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2980  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2268  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.34 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.170931  normal  0.112201 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1656  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.16 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2452  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4735  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0711  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2577  transcriptional regulator, LysR family  31.77 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216536  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1340  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 317 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875316  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3921  transcriptional regulator, LysR family  31.16 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4035  transcriptional regulator, LysR family  31.16 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.176512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1264  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 317 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1158  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3652  transcriptional regulator, LysR family  31.92 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2518  LysR family regulatory protein  31.12 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4144  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1487  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 317 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.235813  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1765  transcriptional regulator, LysR family  28.76 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0963  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 334 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4382  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2975  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819316  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1293  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00171024  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2826  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 302 aa  126  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123766 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1507  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 317 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3187  LysR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 307 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2041  transcriptional regulator, LysR family  28.77 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1817  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  hitchhiker  0.00360584 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1722  LysR substrate-binding  28.42 
 
 		 301 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0793479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5409  LysR family protein  29.62 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1092  transcriptional regulator, LysR family  29.69 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0509948  normal  0.0429857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1185  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000537468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5122  transcriptional regulator, LysR family  27.59 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0178  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1472  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4492  transcriptional regulator, LysR family  30.46 
 
 		 306 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.957194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1590  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4729  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417319  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1646  LysR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4662  transcriptional regulator, LysR family  28.81 
 
 		 329 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3548  transcriptional regulator LysR family  29.05 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1568  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0761  transcriptional regulator, LysR family  28.69 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.211674  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0907  transcriptional regulator, LysR family  28.69 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4202  transcriptional regulator, LysR family  31.93 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1679  transcriptional regulator, LysR family  27.8 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409194  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1591  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0175342  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1111  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5640  transcriptional regulator LysR family  27.3 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2416  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  23.24 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000387203  decreased coverage  0.000000509864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0778  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2072  transcriptional regulator, LysR family  28.06 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0395  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 315 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1720  LysR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3756  LysR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.231956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  27.38 
 
 		 293 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6218  LysR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215178 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5851  LysR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121988  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5425  Transcriptional regulator  26.82 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2216  transcriptional regulator, LysR family  25.5 
 
 		 311 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6622  LysR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.255489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4570  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 298 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6694  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 321 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>