More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0395 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0395  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  619  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1259  transcriptional regulator, LysR family  75.67 
 
 		 300 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4570  LysR family transcriptional regulator  76.61 
 
 		 298 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2416  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  45.64 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000387203  decreased coverage  0.000000509864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0761  transcriptional regulator, LysR family  43.77 
 
 		 316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.211674  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0907  transcriptional regulator, LysR family  43.77 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2041  transcriptional regulator, LysR family  41.99 
 
 		 301 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1092  transcriptional regulator, LysR family  39.44 
 
 		 301 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0509948  normal  0.0429857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1722  LysR substrate-binding  41.13 
 
 		 301 aa  159  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0793479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1272  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 295 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5409  LysR family protein  37.5 
 
 		 300 aa  152  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2518  LysR family regulatory protein  31.8 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0548  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1340  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875316  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1264  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 317 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6622  LysR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.255489 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1472  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1590  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3548  transcriptional regulator LysR family  36.91 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0178  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 303 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1293  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00171024  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3176  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5126  LysR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  0.155944 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6694  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 321 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32621 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4492  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 		 306 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.957194 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3236  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1185  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 310 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000537468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5851  LysR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121988  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02870  putative transcriptional regulator  34.71 
 
 		 313 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238694 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6218  LysR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3825  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.363475 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4202  transcriptional regulator, LysR family  34.48 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0319  putative transcriptional regulator  35.4 
 
 		 313 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3501  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.829127  normal  0.0458146 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3187  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2826  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1679  transcriptional regulator, LysR family  34.76 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409194  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4382  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4662  transcriptional regulator, LysR family  35.32 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0778  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 306 aa  125  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1817  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 310 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  hitchhiker  0.00360584 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5640  transcriptional regulator LysR family  32.8 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5497  transcriptional regulator, LysR family  28.9 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315237  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0223  transcriptional regulator, LysR family  33.61 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239924 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1720  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0418  transcriptional regulator of LysR family protein  51.75 
 
 		 120 aa  123  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0250154 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4629  transcriptional regulator, LysR family  32.37 
 
 		 332 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0711  transcriptional regulator, LysR family  30.67 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1674  transcriptional regulator, LysR family  36.06 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4825  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.861271  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4144  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2928  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 309 aa  119  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2268  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.03 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.170931  normal  0.112201 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3118  transcriptional regulator, LysR family  32.39 
 
 		 313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2577  transcriptional regulator, LysR family  30.03 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216536  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1646  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3790  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.98544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2975  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819316  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1158  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1765  transcriptional regulator, LysR family  34.91 
 
 		 320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1338  putative transcriptional regulator  37.31 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15210  LysR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.017601  hitchhiker  0.00000000286911 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1656  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.33 
 
 		 321 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0140  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0419  transcriptional regulators, LysR family protein  38.2 
 
 		 177 aa  116  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0271253 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3501  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7374  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3921  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 305 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4035  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 305 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.176512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4729  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417319  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1487  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.235813  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3263  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266954  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3652  transcriptional regulator, LysR family  31.86 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4735  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0659  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5280  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5121  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.21 
 
 		 306 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1568  LysR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2256  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6176  transcriptional regulator, LysR family  30.96 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1111  LysR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1591  LysR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0175342  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2072  transcriptional regulator, LysR family  36.89 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751025 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6370  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5122  transcriptional regulator, LysR family  29.97 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1507  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 317 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3380  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 323 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.846396 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1297  LysR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2943  LysR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3069  LysR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227283  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3624  transcriptional regulator, LysR family  32.68 
 
 		 310 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6698  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2528  transcriptional regulator, LysR family  28.67 
 
 		 310 aa  106  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3122  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2216  transcriptional regulator, LysR family  31.92 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4153  LysR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3756  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.231956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3526  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.65 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.33739  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4986  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 304 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.910518 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3568  transcriptional regulator, LysR family  35.09 
 
 		 312 aa  102  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5606  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.37 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22241  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>