More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4153 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4153  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  610  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1765  transcriptional regulator, LysR family  45.3 
 
 		 320 aa  265  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1646  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 317 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4729  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417319  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1568  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1111  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 317 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1591  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0175342  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2928  transcriptional regulator, LysR family  41.02 
 
 		 309 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1487  LysR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 317 aa  245  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.235813  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1507  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3118  transcriptional regulator, LysR family  39.32 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1158  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 301 aa  231  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2577  transcriptional regulator, LysR family  38.98 
 
 		 297 aa  215  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216536  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5122  transcriptional regulator, LysR family  38.13 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2268  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.49 
 
 		 302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.170931  normal  0.112201 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3501  transcriptional regulator, LysR family  35.81 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7374  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3624  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 		 310 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3825  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 306 aa  211  7.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.363475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0711  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 304 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2216  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 		 311 aa  206  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2528  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1264  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 317 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1340  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 317 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875316  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4735  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4035  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 305 aa  202  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.176512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3921  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 305 aa  202  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2518  LysR family regulatory protein  36.75 
 
 		 311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4382  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 300 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4144  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3652  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1656  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.19 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1817  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  hitchhiker  0.00360584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2975  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819316  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1674  transcriptional regulator, LysR family  35.35 
 
 		 312 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3236  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 307 aa  179  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1720  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 304 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3122  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 315 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0178  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0778  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2826  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123766 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2416  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  25.68 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000387203  decreased coverage  0.000000509864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1472  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3176  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5121  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.7 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0761  transcriptional regulator, LysR family  30.95 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.211674  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0907  transcriptional regulator, LysR family  30.24 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2072  transcriptional regulator, LysR family  30.43 
 
 		 305 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5497  transcriptional regulator, LysR family  26.33 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315237  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4825  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.861271  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0140  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1338  putative transcriptional regulator  27.46 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6698  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15210  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.017601  hitchhiker  0.00000000286911 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3187  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2256  LysR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4662  transcriptional regulator, LysR family  26.8 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4202  transcriptional regulator, LysR family  30.14 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5289  LysR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127771  normal  0.048203 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1328  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3105  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2980  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3548  transcriptional regulator LysR family  27.36 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6176  transcriptional regulator, LysR family  27.37 
 
 		 320 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0548  LysR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6370  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1239  transcriptional regulator, LysR family  30.43 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.138802  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1272  LysR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  31.98 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0395  LysR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662274 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1722  LysR substrate-binding  28.77 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0793479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1679  transcriptional regulator, LysR family  26.28 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409194  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  28.08 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5409  LysR family protein  28.93 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4492  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 306 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.957194 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3380  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 323 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.846396 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1242  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00379242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6218  LysR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215178 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3501  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.829127  normal  0.0458146 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2287  nitrogen assimilation regulatory protein Nac, putative  27.33 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5851  LysR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121988  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18090  transcriptional regulator, LysR family  30.95 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.502124  normal  0.864979 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3263  LysR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 307 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266954  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5280  LysR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 318 aa  99.4  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2041  transcriptional regulator, LysR family  27.85 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  33.19 
 
 		 300 aa  99  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0513  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 302 aa  99  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.810346  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3790  LysR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 307 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.98544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1092  transcriptional regulator, LysR family  27.85 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0509948  normal  0.0429857 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3756  LysR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 301 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.231956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0963  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6694  LysR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32621 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2850  LysR family substrate binding transcriptional regulator  28.51 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.46504  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  32.38 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1259  transcriptional regulator, LysR family  27.73 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3069  LysR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 318 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227283  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 293 aa  96.7  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5640  transcriptional regulator LysR family  25.39 
 
 		 300 aa  96.3  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0269  hypothetical protein  32.38 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>