More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2287 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II2287  nitrogen assimilation regulatory protein Nac, putative  100 
 
 		 310 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2980  LysR family transcriptional regulator  97.37 
 
 		 304 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1328  LysR family transcriptional regulator  97.37 
 
 		 304 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3105  LysR family transcriptional regulator  97.37 
 
 		 304 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3380  LysR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 323 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.846396 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6176  transcriptional regulator, LysR family  40.4 
 
 		 320 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6698  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3790  LysR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.98544 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3263  LysR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 307 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266954  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5121  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02127  transcriptional regulator transcription regulator protein  37.17 
 
 		 324 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3069  LysR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 318 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2943  LysR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 326 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1297  LysR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 318 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2256  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 333 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5126  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 319 aa  179  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  0.155944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5497  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315237  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4825  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.861271  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6370  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5647  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.287338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3526  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.89 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.33739  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4986  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.910518 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3711  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 302 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5630  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 302 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0341867 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4657  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 302 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5847  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 302 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5280  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1704  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0659  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15210  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.017601  hitchhiker  0.00000000286911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1338  putative transcriptional regulator  31.08 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2975  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819316  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3652  transcriptional regulator, LysR family  32.13 
 
 		 301 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2452  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4382  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1879  transcriptional regulator, LysR family  33.47 
 
 		 283 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0397318  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4144  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4299  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.31 
 
 		 302 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.941417  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3548  transcriptional regulator LysR family  31.62 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4662  transcriptional regulator, LysR family  32.81 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4035  transcriptional regulator, LysR family  30.13 
 
 		 305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.176512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3921  transcriptional regulator, LysR family  30.13 
 
 		 305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3236  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0963  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0513  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.810346  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1679  transcriptional regulator, LysR family  32.02 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409194  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1568  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1487  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.235813  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4735  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 305 aa  108  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1264  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1507  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1293  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00171024  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1656  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.77 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1340  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875316  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3187  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 307 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1765  transcriptional regulator, LysR family  28.95 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1646  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3825  LysR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 306 aa  105  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.363475 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1591  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 324 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0175342  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1111  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 317 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2518  LysR family regulatory protein  29.47 
 
 		 311 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4729  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 317 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417319  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0319  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0223  transcriptional regulator, LysR family  27.12 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239924 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1763  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 296 aa  103  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5122  transcriptional regulator, LysR family  27.3 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3501  LysR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.829127  normal  0.0458146 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1472  LysR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1590  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0178  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 303 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5409  LysR family protein  29.92 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4629  transcriptional regulator, LysR family  30.12 
 
 		 332 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0711  transcriptional regulator, LysR family  29.37 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4153  LysR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6622  LysR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.255489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1674  transcriptional regulator, LysR family  36.51 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4492  transcriptional regulator, LysR family  29.57 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.957194 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5851  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121988  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4202  transcriptional regulator, LysR family  32.92 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6218  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215178 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6694  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32621 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0778  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 306 aa  99.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1158  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02870  putative transcriptional regulator  29.33 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1092  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 301 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0509948  normal  0.0429857 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2416  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  23.02 
 
 		 297 aa  95.9  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000387203  decreased coverage  0.000000509864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1272  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 295 aa  95.9  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2041  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3715  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5425  Transcriptional regulator  29.97 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3122  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1615  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979938  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1817  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  hitchhiker  0.00360584 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1722  LysR substrate-binding  29.72 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0793479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  27.08 
 
 		 293 aa  93.6  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2928  transcriptional regulator, LysR family  30.17 
 
 		 309 aa  93.2  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1239  transcriptional regulator, LysR family  27.96 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.138802  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2072  transcriptional regulator, LysR family  27.72 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 294 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0622  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 300 aa  92.4  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>