More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4299 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4299  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  100 
 
 		 302 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.941417  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5497  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315237  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5847  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 302 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5630  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0341867 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5647  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.287338 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3711  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4657  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4986  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 304 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.910518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5126  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 319 aa  175  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  0.155944 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5280  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6370  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3526  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.09 
 
 		 301 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.33739  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6698  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2256  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 333 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3069  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 318 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227283  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1297  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2943  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5121  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.03 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0659  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 314 aa  149  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3263  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266954  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1879  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0397318  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4825  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.861271  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3790  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.98544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1338  putative transcriptional regulator  33.67 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15210  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.017601  hitchhiker  0.00000000286911 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6176  transcriptional regulator, LysR family  26.35 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3380  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.846396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1704  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2980  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 304 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1328  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 304 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3105  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 304 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2287  nitrogen assimilation regulatory protein Nac, putative  30.31 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02127  transcriptional regulator transcription regulator protein  27.49 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1158  LysR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 301 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1507  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0513  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.810346  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1646  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5122  transcriptional regulator, LysR family  30.18 
 
 		 298 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1487  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 317 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.235813  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5567  LysR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2452  LysR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2518  LysR family regulatory protein  29.27 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1264  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1340  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875316  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1111  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1591  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0175342  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1568  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 317 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4729  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417319  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3757  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4144  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2268  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.09 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.170931  normal  0.112201 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1765  transcriptional regulator, LysR family  27.66 
 
 		 320 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348978  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2577  transcriptional regulator, LysR family  28.73 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216536  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5289  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127771  normal  0.048203 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5626  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 316 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0807108 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6374  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.436439 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3236  transcriptional regulator, LysR family  25.61 
 
 		 307 aa  99.4  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0178  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 303 aa  99.4  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0711  transcriptional regulator, LysR family  27.43 
 
 		 304 aa  99  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4570  LysR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3825  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.363475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2826  LysR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0140  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1656  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27 
 
 		 321 aa  96.3  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5523  transcriptional regulator, LysR family  27.11 
 
 		 322 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.553864 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4492  transcriptional regulator, LysR family  29.73 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.957194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1817  LysR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 310 aa  93.6  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  hitchhiker  0.00360584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4982  LysR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 307 aa  92.8  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.960154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1259  transcriptional regulator, LysR family  25.55 
 
 		 300 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4735  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0963  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6260  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6662  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6427  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  31.28 
 
 		 293 aa  89.7  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0545  transcriptional regulator, LysR family  25.8 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4044  transcriptional regulator, LysR family  31.25 
 
 		 307 aa  89.4  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.114171 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0395  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3652  transcriptional regulator, LysR family  29.01 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2072  transcriptional regulator, LysR family  29.1 
 
 		 305 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751025 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4035  transcriptional regulator, LysR family  24.91 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.176512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4202  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1720  LysR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3921  transcriptional regulator, LysR family  24.91 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5425  Transcriptional regulator  27.87 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1535  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.65 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.195582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4382  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2416  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  22.49 
 
 		 297 aa  85.5  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000387203  decreased coverage  0.000000509864 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3118  transcriptional regulator, LysR family  30.17 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1674  transcriptional regulator, LysR family  26.53 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1244  transcriptional regulator, LysR family  30.52 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2928  transcriptional regulator, LysR family  27.56 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2509  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123879  normal  0.290889 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0532  transcriptional regulator, LysR family  25.09 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3501  transcriptional regulator, LysR family  28.32 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7374  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4153  LysR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  26.92 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>