More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3118 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3118  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 313 aa  642    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2928  transcriptional regulator, LysR family  79.87 
 
 		 309 aa  520  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3501  transcriptional regulator, LysR family  60.65 
 
 		 310 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7374  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2216  transcriptional regulator, LysR family  64.29 
 
 		 311 aa  396  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2528  transcriptional regulator, LysR family  65.22 
 
 		 310 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3624  transcriptional regulator, LysR family  59.28 
 
 		 310 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1765  transcriptional regulator, LysR family  43.73 
 
 		 320 aa  248  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1646  LysR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 317 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4729  LysR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 317 aa  242  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417319  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1568  LysR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 317 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1158  LysR family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 301 aa  241  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1591  LysR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 324 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0175342  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1111  LysR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1487  LysR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.235813  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1507  LysR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5122  transcriptional regulator, LysR family  42.62 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4153  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4735  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1340  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 317 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1817  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  hitchhiker  0.00360584 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1264  LysR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2268  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.71 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.170931  normal  0.112201 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2577  transcriptional regulator, LysR family  37.71 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2518  LysR family regulatory protein  41.54 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1720  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 304 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0711  transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 		 304 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3825  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.363475 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4382  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1674  transcriptional regulator, LysR family  38.83 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4144  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3652  transcriptional regulator, LysR family  36.61 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1656  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.11 
 
 		 321 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3921  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 305 aa  188  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4035  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 305 aa  188  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.176512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0178  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2975  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819316  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3122  LysR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2826  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0778  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3236  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1679  transcriptional regulator, LysR family  31.53 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409194  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1272  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4662  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 329 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1722  LysR substrate-binding  32.77 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0793479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1092  transcriptional regulator, LysR family  32.77 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0509948  normal  0.0429857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2041  transcriptional regulator, LysR family  32.77 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5409  LysR family protein  30 
 
 		 300 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1185  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000537468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0548  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0140  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1472  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 300 aa  125  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3548  transcriptional regulator LysR family  30.07 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2416  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  29.96 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000387203  decreased coverage  0.000000509864 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3501  LysR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.829127  normal  0.0458146 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5289  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127771  normal  0.048203 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5497  transcriptional regulator, LysR family  29.23 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0395  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1590  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3526  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.04 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.33739  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3176  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 298 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1879  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0397318  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0761  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.211674  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0907  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2072  transcriptional regulator, LysR family  33.84 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751025 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4825  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.861271  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1293  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00171024  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6622  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.255489 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6694  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5851  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121988  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6218  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215178 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5425  Transcriptional regulator  35.65 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4629  transcriptional regulator, LysR family  30.39 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4202  transcriptional regulator, LysR family  30.4 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  32.6 
 
 		 300 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4492  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 306 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.957194 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3187  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 307 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1259  transcriptional regulator, LysR family  29.46 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2775  transcriptional regulator, LysR family  32.52 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0223  transcriptional regulator, LysR family  27.8 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3756  LysR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.231956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5630  LysR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0341867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  25.78 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  26.67 
 
 		 308 aa  102  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5847  LysR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0319  putative transcriptional regulator  31.86 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3711  LysR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02870  putative transcriptional regulator  31.86 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238694 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4657  LysR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5647  LysR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.287338 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3073  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>