More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3501 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3501  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 310 aa  639    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7374  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3624  transcriptional regulator, LysR family  82.85 
 
 		 310 aa  539  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3118  transcriptional regulator, LysR family  60.65 
 
 		 313 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2928  transcriptional regulator, LysR family  59.74 
 
 		 309 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2216  transcriptional regulator, LysR family  54.92 
 
 		 311 aa  335  7e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2528  transcriptional regulator, LysR family  54.24 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1158  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 301 aa  235  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1765  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 320 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4729  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 317 aa  215  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417319  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1568  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 317 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4153  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1646  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 317 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1111  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 317 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1591  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 324 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0175342  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1487  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.235813  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1507  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 317 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5122  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0711  transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 		 304 aa  205  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1817  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  hitchhiker  0.00360584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4735  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2268  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.61 
 
 		 302 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.170931  normal  0.112201 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2577  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216536  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4035  transcriptional regulator, LysR family  34.88 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.176512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3921  transcriptional regulator, LysR family  34.88 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1656  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.27 
 
 		 321 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4144  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 307 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3825  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.363475 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1340  LysR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875316  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1264  LysR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1674  transcriptional regulator, LysR family  36.71 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1720  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3652  transcriptional regulator, LysR family  37.23 
 
 		 301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2518  LysR family regulatory protein  40.43 
 
 		 311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0178  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 303 aa  182  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0778  LysR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4382  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 300 aa  179  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2826  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 302 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2975  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819316  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3122  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 315 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3236  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1272  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1679  transcriptional regulator, LysR family  28.81 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409194  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1092  transcriptional regulator, LysR family  31.91 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0509948  normal  0.0429857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2041  transcriptional regulator, LysR family  31.91 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1722  LysR substrate-binding  31.91 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0793479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2416  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  30.13 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000387203  decreased coverage  0.000000509864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1472  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3548  transcriptional regulator LysR family  27.95 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4662  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 329 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5289  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127771  normal  0.048203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0140  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4492  transcriptional regulator, LysR family  32.9 
 
 		 306 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.957194 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3176  LysR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4202  transcriptional regulator, LysR family  31.25 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3501  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 304 aa  116  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.829127  normal  0.0458146 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5409  LysR family protein  29.79 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0395  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2072  transcriptional regulator, LysR family  31.11 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0548  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1185  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000537468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4825  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 303 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.861271  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3756  LysR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 301 aa  109  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.231956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1259  transcriptional regulator, LysR family  31.39 
 
 		 300 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3187  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1879  transcriptional regulator, LysR family  31.17 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0397318  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1590  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3526  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.17 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.33739  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0761  transcriptional regulator, LysR family  30.81 
 
 		 316 aa  106  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.211674  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0907  transcriptional regulator, LysR family  30.81 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4570  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 298 aa  105  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  25.44 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0223  transcriptional regulator, LysR family  31.22 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239924 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2256  LysR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02870  putative transcriptional regulator  30.39 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238694 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5425  Transcriptional regulator  34.42 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6323  MarR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482978  normal  0.771209 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5280  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0659  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5497  transcriptional regulator, LysR family  29.52 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315237  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  30.97 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5640  transcriptional regulator LysR family  28.83 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5847  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 298 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0319  putative transcriptional regulator  29.9 
 
 		 313 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1239  transcriptional regulator, LysR family  30.87 
 
 		 307 aa  99  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.138802  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3263  LysR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 307 aa  99  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266954  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4629  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2671  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.91 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00916902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5630  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 302 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0341867 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5121  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.45 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0342  transcriptional regulator, LysR family  31.86 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1293  LysR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00171024  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 307 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>