More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3825 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3825  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  625  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.363475 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4144  LysR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2268  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  54.08 
 
 		 302 aa  334  9e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.170931  normal  0.112201 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2577  transcriptional regulator, LysR family  53.4 
 
 		 297 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216536  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1817  LysR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  hitchhiker  0.00360584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4735  LysR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 305 aa  319  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2826  LysR family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 302 aa  318  6e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123766 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4035  transcriptional regulator, LysR family  51.01 
 
 		 305 aa  316  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.176512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3921  transcriptional regulator, LysR family  51.01 
 
 		 305 aa  316  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0178  LysR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 303 aa  308  5.9999999999999995e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3236  transcriptional regulator, LysR family  48.66 
 
 		 307 aa  295  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1656  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  47.8 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1765  transcriptional regulator, LysR family  45.87 
 
 		 320 aa  288  7e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1507  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 317 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1487  LysR family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 317 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.235813  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1646  LysR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 317 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4729  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 317 aa  281  9e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417319  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0778  LysR family transcriptional regulator  51.71 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0711  transcriptional regulator, LysR family  45.95 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1568  LysR family transcriptional regulator  46.78 
 
 		 317 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1158  LysR family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 301 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1591  LysR family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 324 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0175342  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5122  transcriptional regulator, LysR family  47.14 
 
 		 298 aa  275  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1111  LysR family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 317 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4382  LysR family transcriptional regulator  45.15 
 
 		 300 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3652  transcriptional regulator, LysR family  45.24 
 
 		 301 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2975  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 297 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819316  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1720  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1264  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 317 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1340  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875316  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2518  LysR family regulatory protein  37.93 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4153  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 299 aa  211  9e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1674  transcriptional regulator, LysR family  37.24 
 
 		 312 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2928  transcriptional regulator, LysR family  34.45 
 
 		 309 aa  205  8e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2216  transcriptional regulator, LysR family  37.71 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3122  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 315 aa  199  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3118  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2528  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3501  transcriptional regulator, LysR family  34.12 
 
 		 310 aa  186  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7374  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3624  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2416  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  30.1 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000387203  decreased coverage  0.000000509864 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4492  transcriptional regulator, LysR family  32.44 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.957194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4202  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4825  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.861271  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5280  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 318 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3176  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5121  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.07 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1272  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 295 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6370  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 309 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5647  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.287338 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5630  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 302 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0341867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4570  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 298 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4657  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 302 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3711  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 302 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5847  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 302 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5409  LysR family protein  33.45 
 
 		 300 aa  142  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5640  transcriptional regulator LysR family  32.44 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1590  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0140  LysR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3526  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.51 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.33739  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3187  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0548  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1472  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1879  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0397318  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6176  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1259  transcriptional regulator, LysR family  29.87 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0761  transcriptional regulator, LysR family  35.35 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.211674  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0907  transcriptional regulator, LysR family  35.35 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1092  transcriptional regulator, LysR family  33.04 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0509948  normal  0.0429857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5497  transcriptional regulator, LysR family  27.18 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3501  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.829127  normal  0.0458146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1185  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000537468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0963  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 334 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2041  transcriptional regulator, LysR family  30.86 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0395  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 315 aa  132  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1293  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00171024  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1722  LysR substrate-binding  30.47 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0793479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2072  transcriptional regulator, LysR family  29.66 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751025 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4662  transcriptional regulator, LysR family  29.25 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02870  putative transcriptional regulator  29.51 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238694 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5289  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 302 aa  129  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127771  normal  0.048203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15210  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.017601  hitchhiker  0.00000000286911 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4986  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.910518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2256  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1338  putative transcriptional regulator  28.15 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5126  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  0.155944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0319  putative transcriptional regulator  28.82 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6698  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1679  transcriptional regulator, LysR family  28.23 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409194  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3380  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 323 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.846396 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3548  transcriptional regulator LysR family  29.73 
 
 		 318 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0223  transcriptional regulator, LysR family  27.18 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239924 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3069  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2943  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1297  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6218  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215178 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5851  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121988  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6694  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32621 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6622  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.255489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3756  LysR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.231956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>