More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1338 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1338  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 311 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15210  LysR family transcriptional regulator  99.68 
 
 		 311 aa  614  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.017601  hitchhiker  0.00000000286911 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0659  LysR family transcriptional regulator  58.17 
 
 		 314 aa  335  7e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2452  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5126  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  0.155944 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4986  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 304 aa  208  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.910518 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5647  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.287338 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4657  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 302 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3711  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 302 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5630  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0341867 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5847  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5497  transcriptional regulator, LysR family  37.83 
 
 		 316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315237  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3526  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.54 
 
 		 301 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.33739  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6370  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 309 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5280  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 318 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3380  LysR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.846396 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6698  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5121  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.22 
 
 		 306 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6176  transcriptional regulator, LysR family  31.35 
 
 		 320 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2256  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3263  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266954  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3790  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 307 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.98544 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3069  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227283  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1297  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2943  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 326 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4825  LysR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.861271  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1879  transcriptional regulator, LysR family  36.52 
 
 		 283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0397318  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1704  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4492  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 306 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.957194 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4299  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.67 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.941417  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2826  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 302 aa  142  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123766 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5567  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1765  transcriptional regulator, LysR family  31.71 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0178  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4144  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2980  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3105  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1328  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4202  transcriptional regulator, LysR family  31.88 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2287  nitrogen assimilation regulatory protein Nac, putative  31.08 
 
 		 310 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2268  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.43 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.170931  normal  0.112201 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1568  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4729  LysR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417319  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1158  LysR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1646  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5122  transcriptional regulator, LysR family  29.6 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2577  transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216536  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1591  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0175342  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0513  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 302 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.810346  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1111  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3825  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.363475 
 
 
-
 
NC_003296  RS02127  transcriptional regulator transcription regulator protein  25.33 
 
 		 324 aa  125  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3757  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0963  LysR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1817  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  hitchhiker  0.00360584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4735  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 305 aa  123  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1507  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 317 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3236  transcriptional regulator, LysR family  30.17 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4570  LysR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3921  transcriptional regulator, LysR family  30.41 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4035  transcriptional regulator, LysR family  30.41 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.176512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0140  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0711  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1487  LysR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 317 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.235813  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2416  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  26.22 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000387203  decreased coverage  0.000000509864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0223  transcriptional regulator, LysR family  30.36 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1674  transcriptional regulator, LysR family  32.28 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4662  transcriptional regulator, LysR family  28.18 
 
 		 329 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1656  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.11 
 
 		 321 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1259  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1264  LysR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3652  transcriptional regulator, LysR family  30.04 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1340  LysR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875316  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0395  LysR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1679  transcriptional regulator, LysR family  28.96 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409194  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2518  LysR family regulatory protein  27.06 
 
 		 311 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4153  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3548  transcriptional regulator LysR family  28.18 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6218  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215178 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5851  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121988  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4382  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 300 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0778  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2975  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819316  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6694  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32621 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  33.2 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3176  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3122  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6622  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 318 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.255489 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7162  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 317 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5409  LysR family protein  28.9 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5640  transcriptional regulator LysR family  27.65 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4629  transcriptional regulator, LysR family  27.34 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1836  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.8 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.988873  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02870  putative transcriptional regulator  31.64 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238694 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3568  transcriptional regulator, LysR family  27.48 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1722  LysR substrate-binding  29.5 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0793479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1293  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 320 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00171024  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0319  putative transcriptional regulator  30.86 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1590  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1092  transcriptional regulator, LysR family  29.12 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0509948  normal  0.0429857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>