More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1836 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1836  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  100 
 
 		 313 aa  622  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.988873  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7271  LysR family transcriptional regulator  69.31 
 
 		 305 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7486  LysR family transcriptional regulator  68.51 
 
 		 309 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7162  LysR family transcriptional regulator  49.16 
 
 		 317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7274  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 305 aa  269  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  32.36 
 
 		 317 aa  152  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  32.36 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  31.74 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1554  transcriptional regulator, LysR family  31.46 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  31.46 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2252  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 312 aa  146  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5234  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 314 aa  142  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748961  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 302 aa  142  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2558  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 303 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 318 aa  142  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  31.87 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0686  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2873  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3995  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 295 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.66 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4874  transcriptional regulator, LysR family  32.04 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  31.83 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  31.83 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0805  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  29.37 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  32.31 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0457  LysR, substrate-binding  30.41 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0935701  normal  0.110624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  32.36 
 
 		 315 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 297 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  30.38 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6414  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.773226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4248  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6614  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 301 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 301 aa  125  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  31.02 
 
 		 294 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 300 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  31.02 
 
 		 294 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  31.77 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6978  transcriptional regulator, LysR family  31.42 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  32.14 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  32.77 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1650  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0439  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 318 aa  123  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3424  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  32.11 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5983  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.95489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 298 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6247  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 325 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249032  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0452  LysR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6279  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2360  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.612222  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2873  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0282  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2910  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.59 
 
 		 312 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857006  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3769  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.283182  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3544  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816099  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>