More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7162 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7162  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 317 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7274  LysR family transcriptional regulator  52.81 
 
 		 305 aa  328  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7271  LysR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 305 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7486  LysR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1836  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  49.16 
 
 		 313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.988873  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 321 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0805  transcriptional regulator, LysR family  34.24 
 
 		 297 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2873  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  31.97 
 
 		 296 aa  155  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  32.56 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0452  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  29.67 
 
 		 299 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  29.67 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 297 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  32.89 
 
 		 317 aa  149  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2252  transcriptional regulator, LysR family  30.87 
 
 		 296 aa  149  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2360  transcriptional regulator, LysR family  32.33 
 
 		 299 aa  149  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.612222  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 301 aa  148  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1554  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0715  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  31.99 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2873  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  31.56 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 321 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  30.03 
 
 		 303 aa  145  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1925  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 296 aa  145  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.851659  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5234  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748961  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1124  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  28.78 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2319  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 345 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393136 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  30.82 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  30.34 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 296 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 302 aa  142  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1650  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6198  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0517746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.4 
 
 		 304 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1307  transcriptional regulator, LysR family  31.42 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2558  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6978  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3995  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 297 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 294 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 294 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 		 307 aa  135  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2062  transcriptional regulator, LysR family  31.42 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435121  normal  0.841238 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6247  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249032  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  28.05 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2149  transcriptional regulator, LysR family  28.91 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3144  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 300 aa  133  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2910  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.19 
 
 		 312 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857006  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 300 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4248  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0962  LysR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 296 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0930  LysR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 296 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0991  LysR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 296 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0439  LysR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>